| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 4,110,110 | A→G | 3.0% | N61S (AAT→AGT) | cdh → | CDP‑diacylglycerol phosphotidylhydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,110,110 | 0 | A | G | 3.0% | 444.8 / 2.7 | 132 | N61S (AAT→AGT) | cdh | CDP‑diacylglycerol phosphotidylhydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (63/64); new base G (2/2); total (66/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.33e-01 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CCAGGATAATTATCAAACCCGGTGGTTTCTCGCGACCGGGTTTTTTATTTGTCACGATTTTGCGTTACCCTTGCATCTCTTTGAGGTACAGGGAAAAAAAGATGAAAAAAGCGGGTCTTCTTTTTTTGGTGATGATAGTTATCGCCGTTGTGGCTGCCGGTATTGGTTACTGGAAATTAACCGGTGAAGAGTCGGATACATTACGTAAGATTGTCCTTGAGGAATGTTTGCCCAATCAGCAGCAAAATCAAAATCCTTCGCCATGTGCGGAAGTCAAACCCAATGCCGGATACGTGGTTTTAAAAGATCTTAATGGCCCACTGCAATATCTGTTGATGCCAACGTATCGTATTAACGGTACTGAAAGTCCTTTGTTGACCGATCCTTCAACGCCGAACTTCTTTTGGTTGGCTTGGCAGGCGCGTGATTTTATGAGCAAAAAATACGGCCAGCCGGTTCCCGATCGCGCGGTTTCTTTGGCGATCAACTCCCGCACCGGGCGTACGCAAAACCATTTTCATATTCATATCTCTTGTATTCGTCCTGATGTGCGCAAACAGCTGGATAACAA > NC_000913/4109828‑4110398 | ccAGGATAATTATCAAACCCGGTGGTTTCTCGCGACCGGGTTTTTTATTTGTCACGATTTTGCGTTACCCTTGCATCTCTTTGAGGTACAGGGAAAAAAAGATGAAAAAAGCGGGTCTTCTTTTTTTGGTGATGATAGTTATCGCCGTTGTGGCTGCCGGTATTGGTTACTGGAAATTAACCGGTGAAGAGTCGGATACATTACGTAAGATTGTCCTTGAGGAATGTTTGCCCAATCAGCAGCAAAATCAAAATCCTTCGCCATGTGCGGAAGTCAAACCCAATGCCgg > 2:292348/1‑289 (MQ=255) 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CCAGGATAATTATCAAACCCGGTGGTTTCTCGCGACCGGGTTTTTTATTTGTCACGATTTTGCGTTACCCTTGCATCTCTTTGAGGTACAGGGAAAAAAAGATGAAAAAAGCGGGTCTTCTTTTTTTGGTGATGATAGTTATCGCCGTTGTGGCTGCCGGTATTGGTTACTGGAAATTAACCGGTGAAGAGTCGGATACATTACGTAAGATTGTCCTTGAGGAATGTTTGCCCAATCAGCAGCAAAATCAAAATCCTTCGCCATGTGCGGAAGTCAAACCCAATGCCGGATACGTGGTTTTAAAAGATCTTAATGGCCCACTGCAATATCTGTTGATGCCAACGTATCGTATTAACGGTACTGAAAGTCCTTTGTTGACCGATCCTTCAACGCCGAACTTCTTTTGGTTGGCTTGGCAGGCGCGTGATTTTATGAGCAAAAAATACGGCCAGCCGGTTCCCGATCGCGCGGTTTCTTTGGCGATCAACTCCCGCACCGGGCGTACGCAAAACCATTTTCATATTCATATCTCTTGTATTCGTCCTGATGTGCGCAAACAGCTGGATAACAA > NC_000913/4109828‑4110398 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |