Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,375,924 | 0 | T | . | 3.0% | 457.0 / 4.7 | 133 | coding (1058/1368 nt) | dcuD | putative transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/71); new base . (2/2); total (60/73) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
TCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAGGCGTTTCGCCTTTTGCGGTGGTGAAGCGGACAGCGATCCCCATGGCAGTCGGTTTCGTGGTGA > NC_000913/3375638‑3376202 | tcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtg < 1:1023/288‑1 (MQ=255) tcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtg < 2:430847/288‑1 (MQ=255) cgCTTTTCCTCGCCCAACTCGGGGTTATGGAGGCAGAACTGCTTTTGGTGGTGGGTATGTTACTGAGTTGGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCGTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGATGGCGTTTTTTCTCGGCATGGGTACGCAGTTAGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑AGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtgat < 1:865925/289‑1 (MQ=255) cgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtgat < 2:1122011/289‑1 (MQ=255) cgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtgat < 1:810586/289‑1 (MQ=255) cgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtgat < 2:869993/289‑1 (MQ=255) ccACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGgcg < 1:327585/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |