| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,875,524 | G→T | 8.4% | V30F (GTT→TTT) | yidX → | putative lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,875,524 | 0 | G | T | 8.4% | 597.7 / 7.4 | 207 | V30F (GTT→TTT) | yidX | putative lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (97/87); new base T (20/2); total (117/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.45e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
GCGTGATGACGTTCGCGTTTGCCGTGCGTGTAATGTAGTACAAACTTATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAATATCGCTTTACTACTACTGGAATAACGAA > NC_000913/3875236‑3875811 | gCGTGATGACGTTCGCGTTTGCCGTGCGTGTAATGTAGTACAAACTTATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTgg > 2:69139/1‑289 (MQ=255) tGCCGGGCGTGTAATGTAAGACAAACTTATATTGTTTTACTACAATTTAGATCAAAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCGGAAAAGGGATATCAGGAGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAggg < 1:826012/289‑1 (MQ=255) cgtgTAATGTAGTACAAACTTATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCa > 2:50170/1‑289 (MQ=255) cgtgTAATGTAGTACAAACTTATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTAACGGGATTTTTTAAGGCTCCCGGTTTATTCCCACTGCCGTTGATGTTTTCAGGCTTTATCTCGCATGC‑CGTGTTTTCCTTACCGCAAAaggaaagttga > 2:87598/1‑281 (MQ=255) agtaCAAACTTATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTAt < 1:313394/288‑1 (MQ=255) taCAAACTTATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCaa > 2:413001/1‑289 (MQ=255) aCTTATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCa > 2:1075889/1‑260 (MQ=255) aCTTATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCa < 1:1075889/260‑1 (MQ=255) aCTTATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCa > 2:520073/1‑289 (MQ=255) aCTTATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCa > 2:349656/1‑289 (MQ=255) ttATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGTTCTCCCATACCGAAAAGGGTAGCTAAGGAAAGTATAAATCGCAg > 2:1286212/1‑288 (MQ=255) ttATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAggg < 1:1077692/263‑1 (MQ=255) tatTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGGAGTCAg > 2:1229004/1‑289 (MQ=255) ggtgtAATACAAATTAGAACAAAAAAAGAGCAAGTGAAGAACGAATGACTTGGGGCGTGAAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTGTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAAGTTTAAGGTCTTTTTGAAGGATGCCGGTTTATTCCCACTTGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAGGTATCAATCGCAGTCAGacac < 1:1319595/287‑1 (MQ=255) gtACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAATAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAggg < 2:1331781/253‑1 (MQ=255) gtACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCCTGTTTTCCCATACAGCAAAGGGTCGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCa > 2:927245/1‑288 (MQ=255) ctacAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTCGTTTCCCTTACCACAAAGGGTAGTTCAGGAAAGAACCAATCGCAGTCAGACACCTTc > 2:1319595/1‑287 (MQ=255) ctacAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTCGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCAc < 1:489345/289‑1 (MQ=255) aTTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTggga > 2:825835/1‑288 (MQ=255) tAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTGGTCTCCCTTACCGAAAAGGTTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACCAGGCTa > 2:1207234/1‑288 (MQ=255) tAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTATACCAAAAAAGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACAATAACTAGGCTAt > 2:1199644/1‑289 (MQ=255) aaaaaGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATAACGAAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCAACACTGGGCTATCGCAGGCa > 2:963684/1‑289 (MQ=255) aaaaGAACAAAGCATAAAAAAATGACAGGCGGCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAACTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCaa < 1:551448/289‑1 (MQ=255) aaaaaaCAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGAGCAGAAAGCTGAAAAGGGAGAGCAGGCGCTAAACAGTAGGGAAAGAATACAATGCTTTCAACGCCTTAGCTACTCGATTAAAGGATTAATCAGAAAGTTGAATTTTAAGAGATTATTTAAGACTGCCGGGTTATGCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCaaa < 1:1229004/289‑1 (MQ=255) aTGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCg > 1:286782/1‑273 (MQ=255) cATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTaa < 1:1039988/287‑1 (MQ=255) aTAAAAAAAGGAAATGAGTAGGGGAGAAATCTGAAAAGGGATATCGGGCGTAAAACAGGAGGGAAAAAAGAGTATACTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGAGTTTTTAAGGCTGCCGTTTTATTCCCACTGGCGCTGAGGCTTGCAGGCTGTATCGCTTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAAACGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATg < 1:21655/288‑1 (MQ=255) aaaaaTGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACa < 1:251793/289‑1 (MQ=255) tGACATCCGTGCGTCCGAGATCTTAATAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAAGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATAATGAAGTTGAATTTAAAGGGATGTTTTAAGGCTTCCGGTTTATTCCCACTGGCGATGATGCTTTCAAGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGATAGTTCAAGAAAGTATCAATCGCGATCATACTCCATCACTGGGCTATCGCAGTCAAAAGATTGTAATGGAACAAAAgg < 1:365024/289‑1 (MQ=255) gaaattcatctggaaGAAATCTGAAAAGTGATGTCAGTCGCTAAACAGAAGGGAAAAAATATGACCCTTTCAACGGCTTAGCTCCACGTTTAAGGGATTAAACATGAATTTGAATTTTAAGGGATTTTTTATAGCTGCCATCTTATTCCAACTCGCGATGATGCCTTAAGAGTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTTCAATACCGCAAAGGGTAGATCATGAAAATATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATGTCAGGCAAAAGCTTGTAATGGAACAAAAGGc < 1:820998/275‑1 (MQ=255) tCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTCGTTTCCTTTACAGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTTGGCTCTCGCAGGCCAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGTTATG‑tttt > 2:641616/1‑289 (MQ=255) ggCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTCTTTTGCTTTAACACAAAAGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGt > 2:1493298/1‑289 (MQ=255) aaaTCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAgggg < 1:1251759/289‑1 (MQ=255) tGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGAAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATc > 2:1152459/1‑288 (MQ=255) tGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCCTCTTCTGCTTGACAACAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCCTCAATGGGCTATCCCAGGCAAAAGATAGCAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAGTc > 2:813359/1‑288 (MQ=255) gggtatCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGATTATGCTTTGAACGGCTTAGCGACGAGTTTAAAGAATTAATCATGAAGGGAAATTTTAAGGTATATGTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGGGCTGATGCTTTCAGGCTGAATATCGTATGCTCTGGTTGCCCATACCGCAAAGGGTAGTTAAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCAATGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACGAAAGGGTATG‑TTTTTGGAGGGGAATCGCTGGAt < 1:1291821/285‑1 (MQ=255) atatCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAGTCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGacac < 2:1211682/213‑1 (MQ=255) atatCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAggg < 1:416163/180‑1 (MQ=255) ggCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATc > 1:1034016/1‑289 (MQ=255) gcTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTGAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGTTTTCCCATACCGCAAAGGGTAATTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGGTAGGAATGGAACCAAAGGCTAGG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATc > 1:880841/1‑286 (MQ=255) gcTAAACAGAGGGGTAAGACGAGTATGCTTTCAACTGCTTAGCTACTCGTTTAAATGATTAATCATGAAGTGGAATTTTAAGGTGTTTGTTAAAGCGGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCGGATGCTATCAGGCTGGATCTCGTATTCTGTGGTTACCCGTACCGCAAAGGGTAGTTGAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGATACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGTTATG‑TTTTTGTAGCGGAATCGCTGGATTACCTTATCACt < 1:381936/289‑1 (MQ=255) cTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGt > 2:257128/1‑196 (MQ=255) aaCAGGATGGAAAGAAGAGTCTTCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTCAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATg < 1:197262/289‑1 (MQ=255) aaCAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATg < 1:520073/289‑1 (MQ=255) aaCAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTGTTCTGCTAGAACACAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGTCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTTATg > 2:1376709/1‑289 (MQ=255) aaCAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTGTTCTCCCTTACCGAAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTACCAATCGCAGTCAGAGACCATCACTGGGCTATCGCCGCCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTATGGGAATAGCTGGATTAACttttacatgctg > 2:1269098/1‑279 (MQ=255) ggAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGcc > 1:1016587/1‑286 (MQ=255) aaaGAAGGTTATGCGTTTAACGGCTTAGCGACTCGTTTAAAGGATTAATCAGTAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTGCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTAGCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCCCTGATGGTGCCGATGa < 1:1376941/289‑1 (MQ=255) aaaGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAACAAAGAGTAGTTAAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTCGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGa > 2:1513599/1‑289 (MQ=255) ttATGCGTTTAACAGATTATCTACTCGTTTAAAGTGTTAATCATGAAGTTGAATTGTAAGGGAGTTTTTAAGGCTGCCGGTATATTCCGACTGGCGCTGATGCTTTGAGGCTGTATCTCGTATGTTCTGGGTTCCCAGACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATTAATCGCAGTCAGACACCATCGCTGTGCTATCGGATGCAAAAGATCGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAGTCGCTTGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGtt < 1:1152459/287‑1 (MQ=255) tATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGGAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCTTTaa > 1:1052879/1‑289 (MQ=255) tATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTGGTTTCCCATACAGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTaa > 2:1099629/1‑289 (MQ=255) tATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTGGTCTGCCTTACCGAAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCAGGATTACCTTATCACTTATCGTGCCGATGACATCGTTaa > 2:1377797/1‑289 (MQ=255) tATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTCGTCTGCTATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTaa > 2:99257/1‑289 (MQ=255) tATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCCTGGTCTGCTATACAGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTaa > 2:655587/1‑289 (MQ=255) ctGCTTTCTATGGCTTAGATACTCTGTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGAGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCAATAAAGCTGATGCTTTAAGGCTGTATCTCGGAAGCTCGGGTTTCCCAGACCGCAAAGGGTAGTTCCGGAAAGTATCAATCGAAGTCAGCAACCAGCACTGGGCTATCGTAGGCCAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACGGATGGTGCCGAGGACATCGTTAAg < 1:960275/288‑1 (MQ=255) aTGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGTTTTCCCATACAGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGTCACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCGATG‑TTTTTGTGGGGGAATCGATGGGTTATCTTATCACTGATGGTGCCAATGACATCGTTAAg > 2:319473/1‑289 (MQ=255) tttCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTCAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAAt < 2:138284/210‑1 (MQ=255) tttCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATAcc > 2:1339036/1‑135 (MQ=255) ttCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTAc < 1:341450/251‑1 (MQ=255) tCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGa < 1:697889/201‑1 (MQ=255) ttAGCTTATCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGTCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATcc < 2:852251/289‑1 (MQ=255) aGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGa < 2:1160073/141‑1 (MQ=255) aGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGa > 1:1160073/1‑141 (MQ=255) aGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCa > 2:516836/1‑289 (MQ=255) aGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCg < 2:1369004/231‑1 (MQ=255) tAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACAGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACAATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCAAGCACTTAACCg > 2:236919/1‑288 (MQ=255) ttAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGAt < 1:128124/219‑1 (MQ=255) ttAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGt > 1:1346112/1‑237 (MQ=255) tAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGca < 2:96509/283‑1 (MQ=255) tAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGca > 1:96509/1‑283 (MQ=255) aTCATGGAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTGAAGGCTGCCTGTGTATGCCCACTGGCGCTGATGCTTTCATGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATAtt < 2:426265/288‑1 (MQ=255) gAAGTTGAATTTTAAGGGCTTTTTTAAGGCTGCCGCTTTATTCCCCCTGTGGCTGATGCTTTCAGTCTGTATGTGGTATGTTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGTGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATTGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGtt < 1:655587/289‑1 (MQ=255) gAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTCGTTTCCCATACCGAAAAGGGTAGTACAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACAATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATCGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGATGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGATAAATGATCCAGCACTTAACCGCACCAATATTCAGGtt > 2:409802/1‑289 (MQ=255) tttaagcaagttttAAGGCGTCCGGTTTATGTCCACTGGCGCTGATGCTTTCAAGATGTATCTCATATTCTCTGGTTTCCCATACCCCAAAGGGTAGTTCAGAAAAGTATCCATCACAGTCAGACACCATCACTGCGCTAACGCAGGCAAAAGATAGTAAGTGAACAAAACGCGATG‑TATTTGTAGGGTGATCGCTCGATTACCTTATCATTGATGTTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGCTCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGc < 1:683495/279‑1 (MQ=255) aTTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGAtt < 2:1016587/288‑1 (MQ=255) ttttttAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGCTAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGTCGATGAAATCGTTAAGATGCCAAATGATCCAGCAATTAACCGTCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGAAAGATTTg > 1:462040/1‑289 (MQ=255) ttttAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGtt > 1:437262/1‑289 (MQ=255) ccGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACAt < 1:1207537/208‑1 (MQ=255) ccGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATcc > 2:1039271/1‑229 (MQ=255) ccGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTCTTTTCCCATACCGCAAATGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCggg > 2:674587/1‑289 (MQ=255) ttATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGaaa < 2:437262/288‑1 (MQ=255) cccACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTATGGGTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGTAAAGTATCAATCGCAGCCAGACACCATCACTAGGATATCGCAGGCAAAAAATAGTTATGGAACAAAAAGCTATG‑TTTTTGTAAGGGTATCGCTGGATTACCTTATCAATGCTGGTGCCGATGACATCGTTAAGACGCTTCATACTCACGAAACTAAACGGCACAATTATCAGGTTGCACATGCACAAAGTTTTGTTTAAAATGCGGGGaaaaaagaa > 1:63740/1‑285 (MQ=255) cggtgatgaTTTCAGGCTGGATCTCGTATGCGCTTGTTTGCAATACCGCAAAGTTTAATTCAGGAGAGTATCAATCGCAGTTAGACACCATCTCTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTTTAGGGGAAGCGCTGGATTACCTTATGACTGATGGTGACAATGACATCGTTAAGATGCTCAATGTTCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTTCTGATGTCGCAAGATTTGTTTTAAATTCTGGGAAAAATAAATTTACCgg < 1:99257/286‑1 (MQ=255) gcgtaTGCTTTCAGGCTATATTTCGTATGATCTGGTTGCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGAAAAGTATCAATCGCACTCAGACACCATCACTGGGCTAGCTGAGGCAAAAGATAGTAATGGAACATAAGGCTAGT‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACTTTATCACTGATGTTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGTTCCAGCACTTAACAGGCACAATATTCAGGTTTCCGATGACGTCAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCgg < 1:1099629/284‑1 (MQ=255) gcTGATGCTTTCAGGCTTTATCTCGTATGCTCTGGCTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTGAGGAAAGTAGCCAACGCAGTCAGACACCGTCACTCGGCTATAGCAGGAAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTATGGGAATCGCTGTATTACCTTATCAATGATGGTGCAGATGACATCGTTAAGATGCCTAATGTTCCAGAACATAACCGGCAAAATATTCAGGTTGCCGATGACGTAAGATTTGTTTTAAATGCGGTGAAAAAGAAATTTACCgg < 1:1493298/288‑1 (MQ=255) tttCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCg > 1:1481287/1‑214 (MQ=255) tttCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCg < 2:1481287/214‑1 (MQ=255) tttCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAatat < 2:1049975/288‑1 (MQ=255) tCAGGCTGTATCTCGTATGCTTTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAATATCGc < 2:802452/289‑1 (MQ=255) tATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAAc < 1:1338139/108‑1 (MQ=255) tATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAATATCGCTTtact > 1:182403/1‑287 (MQ=255) tATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAATATCGCTTtact > 2:1112971/1‑287 (MQ=255) attctcatatgtgttGGTTTCCCCAACCCCAAGGAGTAGGTCAAGAAAGTATCAATCGAAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAAGCAAAATTTAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCTATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACTCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAATATCGCTTtactac < 1:119934/275‑1 (MQ=255) tctGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAATATCGc < 2:1306656/269‑1 (MQ=255) tctGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAATATCGCTTTACTACTACTGGAATa > 2:119934/1‑287 (MQ=255) tGGTTTCTCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAATATCGCTTTACTACTACTGGAATAACga > 2:35393/1‑289 (MQ=255) tGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTCGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTCCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGTTCCCGCACTTACCCTGCACAATATTCAGGTTGCCGAAGCCGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAATAGCGATTTACTACTATGGGAAtcaaaa > 1:803260/1‑284 (MQ=255) tGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAATATCGCTTTACTACTACTGGAATAACga > 1:769868/1‑289 (MQ=255) gTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCgg > 1:509992/1‑254 (MQ=255) | GCGTGATGACGTTCGCGTTTGCCGTGCGTGTAATGTAGTACAAACTTATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATG‑TTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAATATCGCTTTACTACTACTGGAATAACGAA > NC_000913/3875236‑3875811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |