New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 691852 = | 149 (1.000) | 3 (0.020) | 3/486 | NT | 2.1% | intergenic (‑68/+22) | ybeX/ybeY | putative ion transport/ssRNA‑specific endoribonuclease, 16S rRNA 3' end maturation and quality control co‑endoribonuclease working with RNase R, rRNA transcription antitermination factor |
? | NC_000913 | 691872 = | 141 (0.970) | intergenic (‑88/+2) | ybeX/ybeY | putative ion transport/ssRNA‑specific endoribonuclease, 16S rRNA 3' end maturation and quality control co‑endoribonuclease working with RNase R, rRNA transcription antitermination factor | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
ATCATGATGTCGCGAACGCGTTGGTCTGCGATGTCCATCACCCCTTCGAGCATATCGCGCGTATCTTCGTCGATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAGCCCAGAGCAAGCATAATCTCTGTTTCGAGGGCTTCCATTTCTTCTGCTTCGTCATCTTCGATGTGATCGTAACCTAACA‑AATGCAGACTGCCGTGCACCACCATATGCGCCCAGTGCGCCTCCAGTGGTTTGCCTTGCTCCTGAGCTTCCTTCTCAACCACCTGACGGCAGATAACCAGATCGCCCAGTAGCGACATTTCCATGCCAGGCGGCACTTCAAACGGGAAGGA > NC_000913/691564‑692137 | cATGATGTCGCGAACGCGTTGGTCTGCGATGTCCATCACCCCTTCGAGCATATCGCGCGTATCTTCGTCGATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTg > 2:1245732/1‑288 (MQ=255) taagccgaccaacgtgctctccttcccgtttgaagtgccgcctggcatggaaatgtcgctactgggcgatctggttatctgccgtcaggtggttgagaaggaagctcaggagcaaggcaaaccactggaggcgcactgggcgcatatggtggtgcacggcagtctgcatttgttaggttacgatcacatcgaagatgacgaagcagaagaaatggaagccctcgaaacagagattatgcttgctctgggctatgaggatccgtacattgccgagaaagaataattTGcc > 2:631696‑M1/286‑289 (MQ=255) taagccgaccaacgtgctctccttcccgtttgaagtgccgcctggcatggaaatgtcgctactgggcgatctggttatctgccgtcaggtggttgagaaggaagctcaggagcaaggcaaaccactggaggcgcactgggcgcatatggtggtgcacggcagtctgcatttgttaggttacgatcacatcgaagatgacgaagcagaagaaatggaagccctcgaaacagagattatgcttgctctgggctatgaggatccgtacattgccgagaaagaataattTGcc > 2:1204799‑M1/286‑289 (MQ=255) aaCGCTGTGGTCGTCGTTGTACATCACCCCTTCTGTCATATCGAGCGTATCTTCGTCGATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACTGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAAGCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGACGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGc < 1:330315/288‑1 (MQ=255) tCCATCACCCCTTCGAGCATATCGCGCGTATCTTCGTCGATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTtctc > 2:378464/1‑289 (MQ=255) tCCATCACCCCTTCGAGCATATCGCGCGTATCTTCGTCGATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTtctc > 1:391929/1‑289 (MQ=255) taaCCCCTTCAAGCATCTGTGGCGTATTTTGGTCGTTAAGGTCGTTCTGCCCGAAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAGAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTAGCAAATTATTCTTTCTCGGCa < 1:526177/287‑1 (MQ=255) 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cgcgcgTATCTTCGTCGATAAGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGCCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATa > 2:67891/1‑288 (MQ=255) agcgtcgccgctgaGGTCGTTCTGGCCGGAAGCACGGATGAGCGCCATCAGTGCGTCACGGGTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGCGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCATGTTGTTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTGATCAAAACGCCGTCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAGCCCagag < 1:1178381/276‑1 (MQ=255) aGGTCGTTCTGCCCGGAATCACGGATCAGCGCCAGCAGTTCGTCACGGTTTTTCGGTTCACCGTGGAAAAGTTGGCTGAGTAACAGGGAGAAAAATCCCTTCTTGTTGCTTATCGTGTCACTACTGTGTGAATTGTCGTCGCTCATGGCGTCGTATGGGTTCTCATGTTAGTTAATCAAAACGCCGCCGTTAATCACCAACGGCGGGGACGTCTGCCAGTCAAATGCCTGGCAAATTATTCTTTCTCGGCAATGTACGGATCCTCATAGCCCAGAGCAAGCATAAtctc < 1:67891/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |