New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3845530 = | 110 (0.740) | 8 (0.060) | 8/478 | NT | 8.2% | coding (1568/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase |
? | NC_000913 | = 3992759 | 73 (0.510) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CGAAAATGGTTTTGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGTCAGGGGCTATTTGATGGCGAGAAGTTTGCCTTCACTACGCTGGAAGTCACGGAATAATAAAAAAAGCCCGGCGTCATGCCGGGCAAAAGTCACCAGTTACGTTTATGCCACTGTCAACTGCTGAATTTTTTTCTCGCGGCGGATT > NC_000913/3845246‑3845817 | aaaaTGGTTTTGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGTTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCg > 2:403058/1‑288 (MQ=255) 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tATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGTCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATTACAGCCATAATCTTGTGGTGATCGGGCGCAGTGCCGCAGAGATTGCGCTTGCCGTCAATCAGTTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTTTGCGTGCTCTGCAACGGCCAGGTAAAAAGTCTTCTCACGTTCCCCATTCACGGGAGGATGTGCCACGACCCgcgcgaatctcacgctgacacaagtgac > 1:1361314/1‑262 (MQ=255) tATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGGGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGAc > 2:131757/1‑289 (MQ=255) gAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCCCAGTCGCAGGCCGAACAAATTAACGCCTTGAAAgcc > 1:1054339/1‑288 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |