| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 307,371 | T→A | 3.2% | K654N (AAA→AAT) ‡ | ecpC ← | ECP production outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 307,371 | 0 | T | A | 3.2% | 458.1 / 3.2 | 126 | K654N (AAA→AAT) ‡ | ecpC | ECP production outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (68/52); new base A (2/2); total (71/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.71e-01 | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GGTAACCATCTGCTTCACCTCTGGCTCAATGACAGCGACATTGCCTGGATAGAGAGTCAGACGACTTTTGCGGCCGCTGACGATATCGTAACTGTCGAGTGAGTTTTTGCTGTTCTGTAACTCCACCTCATATCTTCCATAGGGAGAGAGCGGGAGATAGTTACGCTTGCCGTTAAGCGGGAAAATCCGCCCGTTGATTTTGGCGCTGATCTGACCGTCGTCCTCCAGCCCGGTGTTGAATATCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTATCGCCGGAGATGGCACGTGACAGATTGGCACCAACAGTGCGAATGGTTCCTTCATCAAACTGTTTGCGTGCTGACAGGTTTGCCATGGTGTAGCCGTTTTGATGAGTCATCCCTGCGCTAAACCAGTTGCCCAGTGGTA > NC_000913/307086‑307657 | ggTAACCATCTGCTTCACCTCTGGCTCAATGACAGCGACATTGCCTGGATAGAGAGTCAGACGACTTTTGCGGCCGCTGACGATATCGTAACTGTCGAGTGAGTTTTTGCTGTTCTGTAACTCCACCTCATATCTTCCATAGGGAGAGAGCGGGAGATAGTTACGCTTGCCGTTAAGCGGGAAAATCCGCCCGTTGATTTTGGCGCTGATCTGACCGTCGTCCTCCAGCCCGGTGTTGAATATCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGttttt > 1:593193/1‑288 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |