| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 720,761 | G→A | 3.0% | S60N (AGC→AAC) | ybfK → | uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 720,761 | 0 | G | A | 3.0% | 464.3 / 3.4 | 133 | S60N (AGC→AAC) | ybfK | uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/78); new base A (2/2); total (53/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
ATTTTAGGTAATAGCAGGTCCTCAATTTCTCGAATGAGAAATCGATCGTGCCGGAAAAAAGCAAAGTTACCCCGCTGATAAATAAATCAGGTAGATTGCTTTTTTCAGAATGCAGAAACCCTTACCAGTCAGGTGGCTGATAATACAAGGGTTAACAGAGAATGAGCACTGCGGAATACAGGCATATGCCTGTAATACAGAGAGTCAGGAAGACCTGTACGCTGAAGTGCCCTTAGTCGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGCAAACTTCATAATATGAGTTGTCCGCCTTATATGGGGCATAGTGCGGCTGTTATTTTCCATTTAATTTACCTTTCCTGATGTGAATGAAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAA > NC_000913/720474‑721046 | aTTTTAGGTAATAGCAGGTCCTCAATTTCTCGAATGAGAAATCGATCGTGCCGGAAAAAAGCAAAGTTACCCCGCTGATAAATAAATCAGGTAGATTGCTTTTTTCAGAATGCAGAAACCCTTACCAGTCAGGTGGCTGATAATACAAGGGTTAACAGAGAATGAGCACTGCGGAATACAGGCATATGCCTGTAATACAGAGAGTCAGGAAGACCTGTACGCTGAAGTGCCCTTAGTCGGTAGACTAACGGGCATTGAAGAAGTGAAAGTCGAAGCTATTGCGATGAGc < 2:233066/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |