| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,480,272 | A→G | 2.6% | D358G (GAT→GGT) | dsdA → | D‑serine dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,480,272 | 0 | A | G | 2.6% | 531.6 / 2.1 | 152 | D358G (GAT→GGT) | dsdA | D‑serine dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (71/77); new base G (2/2); total (73/79) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.26e-01 | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
AAGGCCGTATCGTCGATGCTGATAACCCTCTGTTTGTCTATCTGCCGTGTGGTGTTGGCGGTGGTCCTGGTGGCGTCGCATTCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTATGTTGTTAGGCGTCCATACAGGATTACACGATCAGATTTCTGTTCAGGATATTGGTATCGACAACCTTACCGCAGCGGATGGCCTTGCAGTTGGTCGCGCATCAGGCTTTGTCGGGCGGGCAATGGAGCGTCTGCTGGATGGCTTCTATACCCTTAGCGATCAAACCATGTATGACATGCTTGGCTGGCTGGCGCAGGAAGAAGGTATTCGTCTTGAACCTTCGGCACTGGCGGGTATGGCCGGACCTCAGCGCGTGTGTGCATCAGTAAGTT‑ACCAACAGATGCACGGTTTCAGCGCAGAACAACTGCGTAATACCACTCA‑TCTGGTGTGGGCGACGGGAGGTGGAATGGTGCCGGAAGAAGAGATGAATCAATATCTGGCAAAAGGCCGTTAATAACGTTTCAACGCAGCATCGCAA > NC_000913/2479984‑2480552 | cggCCATAGCGTGGATGCTGATCTCCCTCTGTTGCTCTGTCTGCCGTTTGGGGTTGGCGGTGGTCCTGGTGGCGTCGCATTCGGGCTTAAACTGGCGTTTTGCGATCATGTTCACGGCTTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTATGTTGTGAGGCGTCCATACAGGATTACACGATCAGATTTCTGGTCAGGATAGTGGTATCGACAACCTTACCGCAGCGGATGGCCTTGCAGTTGGGCGCGCATCAGGCTTTGTCGGGCGGGCAATGGAGCGTCTGCTGGAt < 1:462824/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |