| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,171,054 | A→T | 2.7% | K191N (AAA→AAT) | qseC → | quorum sensing sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with QseB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,171,054 | 0 | A | T | 2.7% | 520.6 / 2.8 | 149 | K191N (AAA→AAT) | qseC | quorum sensing sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with QseB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (73/70); new base T (2/2); total (75/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.10e-01 | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
CTTAATGATGGCGATAACGGAGAAGATATTCCCTATAGCTATCAACGGGAAGGTTTTGCTGACGGGCAACTGGTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATCATCATGATGGT‑ACTACTGGGTCGTGAACTCGCGCCGCTGAACAAACTGGCGCTGGCACTACGTATGCGTGACCCTGACTCGGAAAAACCACTAAACGCGACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCGCACACATGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGCCCGTTAACGGCGCTGAAAGTGCAAACCGAAGTTGCGCAGCTCTCTGACGATGATCCGCAGGCGCGGAAAAAAGCACTGCTCCAATTACATTCCGGGATCGATCGCGC > NC_000913/3170776‑3171338 | cTTAATGATGGCGATAACGGAGAAGATATTCCCTATAGCTATCAACGGGAAGGTTTTGCTGACGGGCAACTGGTCGGTGAAGACGATCCTTGGCGTTTTGTCTGGATGACCTCACCTGATGGCAAATATCGCATCGTTGTTGGCCAGGAATGGGAATACCGTGAAGACATGGCGCTGGCGATTGTTGCCGGGCAATTGATCCCGTGGCTGGTCGCACTGCCGATTATGTTAATCATCATGATGGT‑ACTACTGGGTCGTGAACTTGCGCCGCTGAACAAACTGGCGCTg > 2:1010650/1‑288 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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |