Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,992,437 | 0 | T | G | 38.5% | 126.8 / 283.3 | 200 | L429* (TTA→TGA) | cyaA | adenylate cyclase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/65); new base G (31/46); total (88/112) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.84e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.37e-01 |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
TGTGCGAAAAGCTCAGCCGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCT‑CGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATG > NC_000913/3992149‑3992720 | tgtgCGAAAAGCTCAGCCGTGAACGCGCCTGCGGAGGCTGGCGTAGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCT‑CGTCTGGCAATGCTCGATACCCGCGCTAACTGGAAGATTGACGAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCGCGACGCGAGGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTCGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGCTCACGGAGTGCTGACGCGGACGCCGTATGGCTCGTTTGAAGCAtt > 1:1106328/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |