| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 516,921 | Δ1 bp | 3.2% | coding (339/780 nt) | fetB → | iron export ABC transporter permease, peroxide resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 516,921 | 0 | A | . | 3.2% | 447.4 / 4.2 | 124 | coding (339/780 nt) | fetB | iron export ABC transporter permease, peroxide resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (62/57); new base . (2/2); total (65/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |