| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 4,596,562 | (TGG)3→2 | 2.5% | coding (572‑574/1023 nt) | lgoD → | L‑galactonate oxidoreductase, L‑gulonate oxidoreductase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 4596557 = | 159 (1.350) | 4 (0.040) | 3/488 | NT | 2.5% | coding (567/1023 nt) | lgoD | L‑galactonate oxidoreductase, L‑gulonate oxidoreductase |
| ? | NC_000913 | = 4596553 | 158 (1.390) | coding (563/1023 nt) | lgoD | L‑galactonate oxidoreductase, L‑gulonate oxidoreductase | |||||
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CCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACGGTATTGACCCGCAGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGAT‑GGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCG > NC_000913/4596276‑4596844 | atgcccggcgtgtaaaagcgggcgtaccaattgctgtgaaaaaatttcagtcattggcgtgcatcaggatggcggttttagtgagtatttgagcgtgccggtggcgaacattttgcccgcagacggtattgacccgcaggcggcagcattgattgaacctttcgctattagcgctcatgcggtgcgtcgcgcagccattgctcccggcgagcaggtgctggtggtcggggcggggccaatcggtctgggcgcggcggcaatcgctaaagccgatggcgcacaGgtggtg > 1:756980‑M1/283‑289 (MQ=255)atgcccggcgtgtaaaagcgggcgtaccaattgctgtgaaaaaatttcagtcattggcgtgcatcaggatggcggttttagtgagtatttgagcgtgccggtggcgaacattttgcccgcagacggtattgacccgcaggcggcagcattgattgaacctttcgctattagcgctcatgcggtgcgtcgcgcagccattgctcccggcgagcaggtgctggtggtcggggcggggccaatcggtctgggcgcggcggcaatcgctaaagcagatggtgcacaGgtggtg < 1:316404‑M1/7‑1 (MQ=255) tgcccggcgtgtaaaagcgggcgtaccaattgctgtgaaaaaatttcagtcattggcgtgcatcaggatggcggttttagtgagtatttgagcgtgccggtggcgaacattttgcccgcagacggtattgacccgcaggcggcagcattgattgaacctttcgctattagcgctcatgcggtgcgtcgcgcagccattgctcccggcgagcaggtgctggtggtcggggcggggccaatcggtctgggcgcggcggcaatcgctaaagccgatggcgcacaGGtggtgg > 2:854438‑M1/282‑289 (MQ=255) gtAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACGGTATTGACCCGCAGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGCCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGAA‑GGCGCGCCGGGGGGGGGGGCGGaac > 2:1011444/1‑286 (MQ=255) 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gcggcAATCGCTAAAGCCGAT‑GGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTaa < 1:195800/257‑1 (MQ=255) ctCGCGAAAGCCGAT‑GGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATaaaa < 2:233023/288‑1 (MQ=255) GGTGGTGGCGGATACCAGTCTGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGTTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGCTCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTAGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCGGGAATTCCATACAAAAGCAACGACGATGATGGgcagacg < 1:1052949‑M1/288‑4 (MQ=255) | CCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACGGTATTGACCCGCAGGCGGCAGCATTGATTGAACCTTTCGCTATTAGCGCTCATGCGGTGCGTCGCGCAGCCATTGCTCCCGGCGAGCAGGTGCTGGTGGTCGGGGCGGGGCCAATCGGTCTGGGCGCGGCGGCAATCGCTAAAGCCGAT‑GGCGCACAGGTGGTGGTGGCGGATACCAGTCCGGCGCGCCGTGAACATGTGGCAACGCGTCTGGAATTACCTTTACTGGACCCGTCAGCCGAAGATTTTGACGCGCAGCTACGGGCGCAGTTTGGTGGTTCGCTGGCGCAGAAAGTGATCGACGCGACAGGTAATCAACATGCGATGAATAACACCGTGAATTTGATTCGTCACGGCGGCACGGTGGTATTTGTCGGCCTGTTTAAAGGTGAGTTGCAGTTCTCCGATCCGGAATTCCATAAAAAAGAAACGACGATGATGGGCAGCCG > NC_000913/4596276‑4596844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |