| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,283,309 | C→T | 3.0% | A1149V (GCG→GTG) | narG → | nitrate reductase 1, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,283,309 | 0 | C | T | 3.0% | 432.5 / 3.2 | 134 | A1149V (GCG→GTG) | narG | nitrate reductase 1, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (51/79); new base T (2/2); total (53/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.03e-01 | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GTGATTTCGGTGAAAGCCTGCTGGTTTATCGTCCGCCGATCGACACCCGTTCGGTGAAAGAAGTGATAGGCCAGAAATCCAACGGCAACCAGGAAAAAGCGCTCAACTTCCTGACGCCGCACCAGAAGT‑GGGGTATCCACTCCACCTACAGCGACAACCTGCTGATGCTGACTTTAGGTCGCGGTGGTCCGGTGGTCTGGTTGAGTGAAGCCGATGCCAAAGATCTGGGTATCGCCGATAACGACTGGATTGAAGTCTTCAACAGCAACGGTGCTCTGACTGCCCGTGCGGTTGTCAGCCAGCGTGTTCCGGCAGGGATGACCATGATGTACCACGCGCAGGAACGTATCGTTAACCTGCCTGGTTCGGAAATTACCCAACAGCGTGGTGGTATCCATAACTCGGTCACCCGTATCACGCCGAAACCGACGCATATGATCGGCGGCTATGCCCATCTGGCATACGGCTTTAACTACTATGGCACCGTAGGTTCTAACCGCGATGAGTTTGTTGTAGTGCGTAAGATGAAGAACATTGACTGGTTAGATGGCGAAGGCAATGACCAGGTACAGGAG > NC_000913/1283021‑1283595 | gttaTTTCGGCGGAAGCCTGCTGGTTTATCGTCCGCCGATCGACACCCGTTCGGTGAAAGAAGTGATAGGCCAGAAATCCAACGGCAACCAGGGAAAAGCGCTCAACTTCCTGACGCCGCACCAGAAGT‑GGGGTATCCACTCCACCTACAGCGACAACCTGCTGATGCTGACTTTAGGTCGCGGTGGTCCGGTGGTCTGGTTGAGTGAAGCCGATGCCAAAGATCTGGGTATCGCCGATAACGACTGGATTGAAGTCTTCAACAGCAACGGTGCTCTGACTGCCCGTGc < 1:463729/286‑1 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |