| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,091,825 | T→C | 2.9% | A243A (GCT→GCC) | hisD → | bifunctional histidinal dehydrogenase/ histidinol dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,091,825 | 0 | T | C | 2.9% | 472.2 / 2.8 | 138 | A243A (GCT→GCC) | hisD | bifunctional histidinal dehydrogenase/ histidinol dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (71/63); new base C (2/2); total (73/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.83e-01 | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
ATTGCGGGCTGTAAAAAAGTGGTGCTGTGCTCACCGCCGCCGATTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCT‑GATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTG‑CCGAAACCGCCCGCCAGGCACTGAACGCCAGCCGCCTGATCGTGACTAAAGATTTAGCGCAGTGCGTGGAGATCTCCAACCAGTACGGCCCGGAGCACCTGATCATTCAGACCCGCAACGCCC > NC_000913/2091547‑2092102 | gttGCGGGCTGAAAAAAATGGGGTCGGTGCGCACCGCCGCCGAGTGCCGATGGGAGCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAgcggcg < 2:530315/288‑1 (MQ=255) 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cTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCCGCT‑GCTATGGCGCGTCTCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTG‑CCGCAACCGCCCGCCAGGCACCGAACGCCAGCCGCCTGACCGGGACTAAAGATTTGGCGCAGTGCGTGAAGATCTCCAACCAGTACGGCCCGGAGCACCTGAACATTACGACCCGCCACGccc > 1:457011/1‑289 (MQ=255) | ATTGCGGGCTGTAAAAAAGTGGTGCTGTGCTCACCGCCGCCGATTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCT‑GATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTG‑CCGAAACCGCCCGCCAGGCACTGAACGCCAGCCGCCTGATCGTGACTAAAGATTTAGCGCAGTGCGTGGAGATCTCCAACCAGTACGGCCCGGAGCACCTGATCATTCAGACCCGCAACGCCC > NC_000913/2091547‑2092102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |