| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,495,036 | 0 | C | A | 8.6% | 483.5 / 5.7 | 165 | A343E (GCA→GAA) | nirB | nitrite reductase, large subunit, NAD(P)H‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (91/55); new base A (2/16); total (93/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.03e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 | |||||||||||
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
TAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCGGTGAATGCGCAAGCTGGAACAACCGTGTATTTGGTCTGGTAGCACCTGGCTACAAAATGGCGCAGGTCGCCGTTGACCATATTCTCGGTAGCGAAAACGCCTTTGAAGGTGCTGACCTTAGCGCCAAGCTGAAACTGCTGGGCGTAGACGTAGGCGGTATTGGTGATGCGCACGGTCGCACGCCTGGCGCACGTAGCTACGTTTACCTCGACGAAAGTAAAGAGATCTACAAACGCCTGATTGTCAGCGAAGACAACAAAACCCTGCTCGGTGCGGTACTGGTGGGCGATACCAGCGACTACGGTAACCTGCTGCAACTGGTGCTGAACGCTATCGAACTGCCGGAAAACCCGGATTCCCTGATCCTGCCAGCACACTCGGGTAGCGGCAAGCCGTCTATCGGTGTTGATAAACTGCCGGACAGCGCGCAAATCTGCTCCTGCTTCGACGTCACCAAAGGTGATCTGATTGCTGCCA > NC_000913/3494749‑3495323 | tAAGCTGGCAACCCAGTGTGGTCTGGACGTTGCTCCGCGTGGGGGTATTGTCATTAATGATTCCTGCCAGACTTCCGATCCGGATATCTACGCCATCGGTGAATGCGCAAGCTGGAACAACCGTGTATTTGGTCTGGTAGCACCTGGCTACAAAATGGCGCAGGTCGCCGTTGACCATATTCTCGGTAGCGAAAACGCCTTTGAAGGTGCTGACCTTAGCGCCAAGCTGAAACTGCTGGGCGTAGACGTAGGCGGTATTGGTGATGCGCACGGTCGCACGCCTGgcgc < 2:768993/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |