New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1287329 | 25 (0.550) | 4 (0.130) | 4/342 | NT | 16.5% | intergenic (‑1/+209) | tyrV/tyrT | tRNA‑Tyr/tRNA‑Tyr |
? | NC_000913 | 1287624 = | 24 (0.800) | intergenic (‑2/+158) | tyrT/purU | tRNA‑Tyr/formyltetrahydrofolate hydrolase |
CTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCT‑CCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGG > NC_000913/1287053‑1287613 | cTTTTGGAAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGTGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCa < 1:271329/288‑1 (MQ=255) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTa > 1:23853/1‑289 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTACTCGGCGCTGCGCGCTTCGCCCGTCGGGTCGTTGCCTGCTGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAAt < 1:275662/289‑1 (MQ=255) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGTGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAcggggta < 1:385396‑M1/246‑8 (MQ=255) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAcggggta > 2:385396‑M1/1‑239 (MQ=255) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCACATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGCGATGGTGGTGGGGGGAGGATTCGTACCTTTGAAGTCGATGACGGTAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTTGGGAACCCCACCAGGGGTAATGCAAATGTTGAGGTAATGCTTGAGATGCTGGTGGGGGAAGGa > 1:398871/1‑289 (MQ=25) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCTCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATCCGTTTGGAAGGTCAGGGAGATTTGAAAATGATGGTGGTGGGGCGAGGATGCGAACCTTCGAAGGCGATGACGGCTGAGTTACAGTCTCATCCCCGTTGCCTGCCGGCAACACCCCCGGGTGGAAGTCATCTTGTGTGGTCTTGCTTGAAGAGGTGGTgggggccggcatgtc > 2:50641/1‑279 (MQ=12) gTCGTTGCCTGCGGCACCGCTCTCTCGCTAGCGCTCGAGTCGAACCTTGTTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCTGATTCGTTGGGAACTGCAGGGACGTTTGAAAGTGATGGTGGTTGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTGGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTTGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGct‑cctc < 1:405324/288‑1 (MQ=37) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGGAATTCAATTTTTGAGTGCTTGCTCCGGATGGTGACGCGGGACGGATTATtcgacacgccgctcaccgc > 2:374305/1‑271 (MQ=21) tGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTGTTCTTTTGCGGAAAGGCTCGAGATGGGGATCGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCC‑CACCGCCCTTCgg > 2:150783/1‑288 (MQ=25) gcTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAACGGCTGCTCCCCTTGGACGCCCGGGAAACCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGTGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGTGGGAAGTGTTATTGTTCGCTTACCTACCTC‑CCCTTCGGGCCAGTGCTTGTGGcgcaggtt > 2:16118/1‑280 (MQ=25) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAcggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 2:261841‑M1/229‑68 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAcggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg > 1:261841‑M1/1‑162 (MQ=255) ccTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGATATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCT‑CCTCTCCCTTCGGGCCTTTGCCTGTGGCAATGTTCTCCCGCTTTCGCTCGAATCCAACCTTAGTCGTAg > 1:220287/1‑289 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCT‑CCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGt > 2:18662/1‑287 (MQ=255) cccACATGTGAAGAAGTTTTAATTGCGGATTCGTTGGGAGGTTCAGGGACTTTGGAAAGTGATGGGTGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGGCGCGCGGGACCCCCACGACGGGTAAGTAAAATTGAGAGGTAATGATTGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCT‑CCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGCCGAAGGTtct < 2:23853/289‑1 (MQ=37) aTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt > 2:252291/1‑171 (MQ=255) aTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 1:252291/171‑1 (MQ=255) cGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGCCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGTAATTGCTATTTTCAGGTCATGCCTGCGATCGTGGTGGCGGAAGGACTATTCATCCCGCCGCC‑TCTCACGCTTCGGTCCGTTTCCTTTGGCGACGTTCTCTCGCCTTCCCTCAAACCGAACTCTCTTCGAAGTCTCCTACCCTTCCCCTACTAATGCAAACt > 2:298473/1‑289 (MQ=16) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCT‑CCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCAcc > 1:18311/1‑277 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCT‑CCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCAcc < 2:18311/277‑1 (MQ=255) ttGAAAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCT‑CCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACAt < 2:398871/289‑1 (MQ=255) agtggggtggtgggggaaGGATGGGGACGGTGGGAGTCGGTGGCGGCAGATTGGCAGTCGGGGCCCTTGGGGCGCTCGGGAACCCCACCAcggggtaatggtttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggtgcatcatatcaaatgacgcgccgctgtaaagtgttacgttgagaaaaatgaactggttgcgtaattttcatccgtaacggattaaaggtaaccagttatttttgctggcgattaaagaataatcgttcgattaccgtaaacaaagacgcgc < 1:363995‑M1/283‑199 (MQ=255) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCT‑CCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCtgtg < 1:18662/288‑1 (MQ=255) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA > 2:342423‑M1/1‑88 (MQ=255) tggttggggGGGAATGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCTCTCGGGAACCCCCACATGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGAGGAAGAATTATTCGTCGCTTCGCT‑CCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGAAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTgtggtg < 1:16118/289‑1 (MQ=39) 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ggggAAGGGTTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGACTGCTCCCTTGGGCCGGTCGGGAACCCCACCAcggggtaatgctttttactgccctgctcccttatcgggaagcggggggcatcaaatcaaatgacgcgccgctgtaaagtgttacgttgagaaaaatgaactggttgcgtaattttcatccgtaacggattaaaggtaaccagttatttttgctggcgattaaagaataatcgttcgattaccgtaaacaaagacgcgctgtgccagtact < 1:150783‑M1/288‑211 (MQ=255) aGGGTTCGAACCGTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACGGTCTTCTCCCTTTGTCCGCTCGGGAACCCCACCAcggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgctgtaaagtgttacgttgagaaaaatgaactgtttgcgtaattttcatccgtaacggattaaaggtaaccagttatttttgctggcgattaaagaataatcgttcgattaccgtaaacaaagacgcgctgtgccattactttgta < 1:341329‑M1/288‑216 (MQ=255) ttCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAcggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgctgtaaagtgttacgttgagaaaaatgaactggttgcgtaattttcatccgtaacggattaaaggtaaccagttatttttgctggcgattaaagaata < 2:340713‑M1/229‑169 (MQ=255) ttCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAcggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgctgtaaagtgttacgttgagaaaaatgaactggttgcgtaattttcatccgtaacggattaaaggtaaccagttatttttgctggcgattaaagaata > 1:340713‑M1/1‑61 (MQ=255) cGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAcggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaactgacgcgccgctgtaaagtgttacgttgagaaaaatgaactggttgcgtaattttcatccgtaa > 1:363102‑M1/1‑59 (MQ=255) cGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAcggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgctgtaaagtgttacgttgagaaaaatgaactggttgcgtaattttcatccgtaaaggattaaaggtaaccagttatttttgctggcgattaaagaataatcgttcgattactgtaaaaaaagacgccctgtgcacttactttgtatagtgcaggccttaa > 2:34044‑M1/1‑59 (MQ=255) cGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAcggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgctgtaaagtgttacgttgagaaaaatgaactggttgcgtaattttcatccgtaa < 2:363102‑M1/183‑125 (MQ=255) aCGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCT‑CCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCtt < 2:74481/283‑1 (MQ=255) aCGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCT‑CCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCtt > 1:74481/1‑283 (MQ=255) ttACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAGCCCTACCAGGGGTAATTCAAATTTTGTGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCT‑CCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 1:308625/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |