New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3845530 = | 37 (0.810) | 25 (0.570) | 24/496 | NT | 37.2% | coding (1568/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase |
? | NC_000913 | = 3992759 | 49 (1.120) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
CACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGCCTGGTAGGTAGCGTTGACCTGCTGTACCGCAACTCGTGGAACGAAGTGCGTACGCTGCACTTCAACGGCGAGCAATCGATGATCGAAGCCCTGAAAACTATTCTCGGCAAAATGCATCAGGACGCCGCA > NC_000913/3992473‑3993047 | cACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGACAAATATTTAGTCGATCATCCGCCATCAGCCGCCGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGCCGATTTGCCCAAGTTGCAGGAGATGGTCGACGAAGGGTCGCAACATTTCCCGCTGCGCCTACGTgg > 2:20110/1‑288 (MQ=255) ccTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaa > 2:406759‑M2/1‑260 (MQ=255) ccgccgGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGGAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacgcggcgcagtcgctggcgggacaaattgacgcctt < 2:96738‑M2/289‑44 (MQ=255) cAGGTTGGTATCTGGATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTCCCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgc > 2:82082‑M2/1‑224 (MQ=255) 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cGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGgc < 2:6916/90‑1 (MQ=255) ggCATTGTCGAGTTGCCTAAGTGTCAGGGGAGGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGCCTGGTAGGTAGCGTTGACCTGCTGTACCGCAACTCGTGGAACGAAGTGCGTACGCTg < 2:285084/288‑1 (MQ=255) ttGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGCCTGGTAGGTAGCGTTGACCTGCTGTACCGCAACTCGTGGAACGAAGTGCGTACGCTGCACt > 2:21774/1‑288 (MQ=255) tGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGCCTGGTAGGTAGCGTTGACCTGCTGTACCGCAACTCGTGGAACGAAGTGCGTACGCTGCACTTc > 2:239490/1‑289 (MQ=255) tCGATTTGCCTAAGTTGCAGGATATGGTCGCCGACGTGCCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagacgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaaccagtcaggggctatttgatggcgagaagtttgccttcactacgctggaagtcacggaataataaaaaaagcccggcgtcatgcc > 1:377398‑M2/1‑65 (MQ=255) aTTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgctccccgcgctaaaactaaccagtcaggggctatttgatggcgagaagtttgccttcactacgctggaagtcccggaataataaaaaaagcccggagtcatgccgggc < 2:187380‑M2/289‑228 (MQ=255) ttGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGCCTGGTAGGTAGCGTTGACCTGCTGTACCGCAACTCGTGGAACGAAGTGCGTACGCTGCACTTCAACGGCg < 1:239490/289‑1 (MQ=255) gCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGCCTGGTAGGTAGCGTTGACCTGCTGTACCGCAACTCGTGGAACGAAGTGCGTACGCTGCACTTCAACGGCGAg < 1:203108/289‑1 (MQ=255) gCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGCCTGGTAGGTAGCGTTGACCTGCTGTACCGCAACTCGTGGAACGAAGTGCGTACGCTGCACTTCAACGGCGAg < 2:140794/289‑1 (MQ=255) gTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaaccagtcaggggctatttgatggcgagaagtttgccttcac > 2:316046‑M2/1‑52 (MQ=255) gTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaaccagtcaggggctatttgatggcgagaagtttgccttcac < 1:316046‑M2/230‑179 (MQ=255) ttGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaaccagtcaggggctatttgatggcgagaagtttggcttcactacgctggaagtcacggaaaaataaaaaaagcccggcgtcatgccttgctcttatacaca < 1:219531‑M2/289‑239 (MQ=255) cAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGc > 1:210052/1‑207 (MQ=255) cAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGc < 2:210052/207‑1 (MQ=255) aGGACATGGTCGCCGCCGTGTCGCGCCATTTCCCGCTGCGCTGACCTgcaccgacacggggcagtcgctggcgtaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccatgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatagcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaacccgtcaggggctatttgatggctagaagtttgccttcactacgctggaagtcacggaataataaaaaaagcccggcgtcatgccgggcaaaagtcaccagtt > 1:328439‑M2/1‑47 (MQ=255) 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tGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaaccagtcaggggctatttgatggcgagaagtttgccttcactacgctggaagtcacgga > 1:65431‑M2/1‑11 (MQ=255) tGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaaccagtcaggggctatttgatggcgagaagtttgccttcactacgctggaagtcacgga < 2:65431‑M2/207‑197 (MQ=255) cgcTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGCCTGGTAGGTAGCGTTGACCTGCTGTACCGCAACTCGTGGAACGAAGTGCGTACGCTGCa > 2:238956/1‑227 (MQ=255) cgcTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGCCTGGTAGGTAGCGTTGACCTGCTGTACCGCAACTCGTGGAACGAAGTGCGTACGCTGCa < 1:238956/227‑1 (MQ=255) tGCACCGACACCGAAGGCGCTCTGCAACCCGTGTGGGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGCCTGGTAGGTAGCGTTGACCTGCTGTACCGCAACTCGTGGAACGAAGTGCGTACGCTGCACTTCAACGGCGAGCAATCGATGATCGAAGCCCTGAAAACTATTCTCGGCAAAATGCATCAGGACGCCGCa < 2:26875/289‑1 (MQ=255) | CACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGCCTGGTAGGTAGCGTTGACCTGCTGTACCGCAACTCGTGGAACGAAGTGCGTACGCTGCACTTCAACGGCGAGCAATCGATGATCGAAGCCCTGAAAACTATTCTCGGCAAAATGCATCAGGACGCCGCA > NC_000913/3992473‑3993047 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |