Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,698,606:2 | +C | 2.9% | coding (394/1680 nt) | bcsG → | DUF3260 family cellulose production inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,698,604 | 2 | . | C | 2.9% | 595.3 / 10.5 | 138 | coding (392/1680 nt) | bcsG | DUF3260 family cellulose production inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (67/67); new base C (2/2); total (69/69) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.79e-01 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GGCGGGATATCTTAACTTCCATCCGCTCCTCAATTTGGTGTTTGCCGCGTTTCTGCTGATGCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATT‑‑CCTGTCACAATGGATTCGCATTACCGTTTTTGTGGTTGCCATACTGCTATGGCTGAACGTACTTACCCTGGCGGGACCAAGTTTCTCCTTGTGGCCAGCCGGACAACCGACGACCACTGTAACAACGACGGGTGGTAACGCAGCGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCC > NC_000913/3698320‑3698885 | ggCGGGACATCTTAACTTCCATCCGCTCCTCAATTTGGTGTTTGCCGCGTTTCTGCTGATGCCCCTTCCGCGCTACAGCCTGCATCGCTTGCGCCACTGGATTGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGTAGAGTGGGGCAATGTTTGTTTTATTAGTGGACTGGTTAtt > 1:9062/1‑285 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |