| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2531963 | 130 (0.940) | 4 (0.030) | 3/496 | NT | 2.6% | coding (503/762 nt) | cysZ | sulfate transporter, sulfite inhibited |
| ? | NC_000913 | = 2532165 | 169 (1.270) | coding (705/762 nt) | cysZ | sulfate transporter, sulfite inhibited | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TTATCTGTTGTGGCCTCTGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTACCGGTTATTTTGTAAACCGT > NC_000913/2531679‑2532249 | ttATCTGTTGTGGCCTCTGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGt < 1:404345/288‑1 (MQ=255) 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ccTCTGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGt > 1:1025015/1‑289 (MQ=255) ctctGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCACCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGtt < 1:370351/289‑1 (MQ=255) tGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCCAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGGATTCCTAATTCTTTACTTCATTCCTGGTATTGGGCAAACGGTGGCGCCGGTACTTTGGTTCCTGtttg > 2:524086/1‑287 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |