Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,622,957 | 0 | A | G | 3.2% | 502.3 / 2.6 | 151 | intergenic (‑43/+3) | mgrR/dgcZ | sRNA antisense regulator down regulates YgdQ and EptB, PhoPQ‑regulated, Hfq‑dependent, affects sensitivity to antimicrobial peptides/diguanylate cyclase, zinc‑sensing |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (67/77); new base G (2/4); total (69/82) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.87e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.48e-01 |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
GGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAATAAACATGCAGCGATTTCTTCCGGTTTGCTTACCCTCATACATTGCCCGGTCCGCTCTTCCAATGACCACATCCAGAGGCTCTTCAGGAAATGCGCGACTCACACCTGCTGTCACGGTAATGTTGATATGCCCTTCAGAATGTGTGATGGCATGGTTATCGACTAACTGGCAAATTCTGACACCTGCACGACATGCTTCTTCATCATTAGCCGCTTTGACAATAATGATAAATTCTTCGCCCCCGTAGCGATAA > NC_000913/1622672‑1623245 | ttaagagacgggAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATAGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGCCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGGCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAATCCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCt < 1:1178039/280‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |