| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,938,905 | A→G | 7.8% | D227G (GAC→GGC) | rbsR → | transcriptional repressor of ribose metabolism |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,938,905 | 0 | A | G | 7.8% | 520.3 / 2.3 | 200 | D227G (GAC→GGC) | rbsR | transcriptional repressor of ribose metabolism |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (68/108); new base G (17/3); total (88/112) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.97e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
TGAAATCATGCAACGTTATCCGACAGTGCCTACTGTGATGATGGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGACCCTTCAGCAACAACGATTACAACTTACTCC > NC_000913/3938618‑3939190 | caCGGTATCCGGCAGTTCCTACTGTGATGATGGACTTGGCTCCGGTCGATTGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGTGCGGAGACTTATCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGTCTGCGGTTTGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGTGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGcc < 2:1267747/287‑1 (MQ=255) aaCGTTATCCGACAGTGCCTACTGTGATGATGGACTGGGCGCCGTTCGATGGCGAAAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGcc < 2:255486/288‑1 (MQ=255) ttATCCGACAGTGCCTACTGTGATGATGGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTg < 2:1040031/289‑1 (MQ=255) tATCCGACAGTGCCTACTGTGATGATGGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTg < 1:1074202/288‑1 (MQ=255) tCCGACAGTGCCTACTGTGATGATGGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGGAGGTTATCGGGCGGCTATAAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGAGGTGTTGACGGT‑ATGCGGCAACTgttg > 2:1027025/1‑286 (MQ=255) tCCGACAGTGCCTACTGTGATGATGGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑Ta > 1:535676/1‑289 (MQ=255) cAGTGCCTACTGTGATGATGGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAAACGC‑TATcaca > 1:1081085/1‑289 (MQ=255) gTGCCTACTGTGATGATGGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCTCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCTCCAATTGC‑TTCCACAt > 1:365183/1‑288 (MQ=255) tGCCTACTGTGATGATGGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGCAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGGCGCT‑ATGTGCCaaacggtctcacacc > 1:938197/1‑275 (MQ=255) tGCCTACTGTGATGATGGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACGGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGGTTTACGCTCATG‑GCCAACCGC‑TATcccacc > 2:50331/1‑286 (MQ=255) ccTACTGTGATGATGGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGTGCCAACTTC‑TATCACATcc > 1:102081/1‑287 (MQ=255) gatgatGGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTAAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGGTTGAAGCC‑ATGCGCCAACTTC‑CATCCAAACCGCTGCGttca > 1:219604/1‑286 (MQ=255) gatgGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGGCCCT‑ATGCGCCAACTTC‑TTTCACAttcctcgcctcct > 2:976415/1‑274 (MQ=255) atgGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAg > 1:443043/1‑288 (MQ=255) gggCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCggcct > 1:986934/1‑285 (MQ=255) ggCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCACCTTC‑TATTACATCCGCTCCGTCC‑CCACGCCG‑T‑Attt > 2:371215/1‑289 (MQ=255) cTCCGTTTGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGGTTGCAGGT‑ATGCGCCCAGATC‑TATCACAACCCGCGGGTTC‑TCCGGCCG‑T‑CTTTa > 1:25186/1‑288 (MQ=255) cTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTAGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑a > 1:1035242/1‑243 (MQ=255) tCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTAc < 1:1178898/288‑1 (MQ=255) ccggttcagtGGCGACATCCATCTTATTATGGAGAACTCGTTGGTGGGCGGAAACGTAGCAAAGCAATATCGGGGCAAAAACGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CGTTAcc < 2:779181/280‑1 (MQ=255) cGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCaa > 1:710891/1‑248 (MQ=255) gATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGATATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTTGCCCC‑ATCCGCCCACTGC‑CTAAACATCCGCTTCGTCG‑CCAGGCCG‑TCCTTTAcggcacag > 2:609287/1‑282 (MQ=255) tGGCGACAGCGATCTTTTTCAGTATAACTGGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGa < 2:516108/288‑1 (MQ=255) aGCGATCTGATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCACCGCAATTTCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCGTTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCCGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATgg < 2:154678/289‑1 (MQ=255) tCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑t < 1:678840/288‑1 (MQ=255) acTTTTTCCGGATAAAGCTTTGCAGGGCGAACACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGGCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑tt < 2:1087633/288‑1 (MQ=255) ttATTGAGTATAACTCGTTGCTGGGCGGGGACTTAGCAACGCCATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCTGATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTgg < 2:986934/289‑1 (MQ=255) aTTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTCGCAACTCAATATCTGATCGAGAATGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGGTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCg < 2:328378/289‑1 (MQ=255) gATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTTTATCACCGGCCCGCCGGATAAAACTCCGGCGCGCCTTCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTTTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGGCATTGGTGATTTTGAATTTAACGGAGGGTTTGGCAGT‑ATGGCCCAACTGC‑TTACACAACCGCCGCGTGC‑TCCTGACG‑C‑CCTTTTCGGAAATGACGACATCGCTG‑TTTGGGGTTAc > 2:1144572/1‑288 (MQ=255) gATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGACACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGGAGCT‑CTGCGCCCAACGG‑TATACCAAACGCTCCGTTC‑CCAGGCCGTT‑CTTTACCGG‑AATGACGCCATCGCGG‑GTGGCGttttca > 2:807134/1‑286 (MQ=255) gATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTTAAGCT‑ATGCGCCAAATGC‑TATCACATCCTCTGCGTCC‑TCACGCCG‑T‑CTTTCCCCGAAAAGACGCTATGGCTG‑TTGGAGTTTatc > 1:1016199/1‑287 (MQ=255) gATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑a < 2:1003566/211‑1 (MQ=255) gATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGAAGCT‑ATGGGACAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTAC‑TCAGGCCG‑G‑CTTTACCGGAAATGACGCCATGGCTggtagtggttac > 1:769889/1‑277 (MQ=255) atgaCTCGGTTCTGTGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCGGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTGATCGAGCGGCGATGAAACGTGCGGGGCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTAcc < 2:1219765/285‑1 (MQ=255) agaccTCGTTGCTGGGCGCCGAGTTAGCAACGCAATATCTAATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTAcc < 1:633702/284‑1 (MQ=255) aTAACTCGTTGCTGGGGGGAGATTTAGCAACGCAGTATCTGTTGGATAAAGGTCAGACCCGTATGGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTAcc < 2:1016077/288‑1 (MQ=255) aTAACTCGTTGCTGGGCGGAGCCTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAGAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTAcc < 1:231805/288‑1 (MQ=255) aTAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTAcc < 2:1254179/288‑1 (MQ=255) cttgTTACTGGACAGAGACTTAGCAACGCAATATCCGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGGCGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCg < 2:443913/286‑1 (MQ=255) cTCGTTGCTGGGCGGAGACGTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTAGCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTTATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCg < 1:807134/289‑1 (MQ=255) gTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTAcc < 1:669708/281‑1 (MQ=255) tGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGGGCCAACTGC‑CATTACATCCCCTTCGTCC‑TCCGGCCG‑T‑CTTTACCGGGAATGACGCTATGGCTG‑TTGGTGtttgcacggggtttat > 1:1138162/1‑276 (MQ=255) tGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCC‑CTGCGGCAACTGC‑TATCACACCCGCTGCGTTC‑TCAAGGCG‑T‑CTTTTCCGGAAATGACGCTATGGGCG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTtata > 1:988871/1‑289 (MQ=255) ggCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAAt < 2:443012/249‑1 (MQ=255) gCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAgg < 2:11845/288‑1 (MQ=255) ggAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCa < 2:37893/288‑1 (MQ=255) ggAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCa < 1:1206134/288‑1 (MQ=255) ttAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCGGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTAc < 2:229719/289‑1 (MQ=255) aatgCAATATCTGATCGATAAAGGTCAGACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAATACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGGAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGCTGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCTCCAACTTC‑TATCACATCCGCTTCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGTAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAgg < 1:931303/284‑1 (MQ=255) aaCGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATGACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAgg < 1:998729/287‑1 (MQ=255) aCGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCC‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTGC‑TCAGGCCG‑C‑CTTTTCCGGAAATGACACTATGGACG‑TTGGCGTCTTCCATGCGGTATTACAggggaaggtaaaggg > 2:1079501/1‑274 (MQ=255) gCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCg < 1:861370/289‑1 (MQ=255) aaTTTCTGATCGATAAAGGTCCTACCCGGATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAATCTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCa < 2:781324/289‑1 (MQ=255) tCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTTACGAT‑ATTCGCCAACTTC‑TATCACATCCGACTCGTCCTTCAGG‑CG‑T‑CTTTTCCCGAAATGACGGCATTGTCC‑TTGGGTGTTACCATGCGGTATATTCGGGAGAGGTTACA‑GTTCCGCaaggt > 2:664924/1‑285 (MQ=255) cTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCa < 1:280040/284‑1 (MQ=255) aTCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAgg < 2:216723/262‑1 (MQ=255) aTCGACAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTACGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAAAATTCCTGATGGCCATGAAGTCACTGGTGAGTTTGAATTTAACGGCGGGGTTGATGAT‑ATGAGCC‑ACTGCGCAGCACATCCGCTGCGTCC‑TTAGGCCA‑T‑TCTTACCGCGAATGGCCCTCTGGCCT‑TTGGCGTTTTCCCGGTGCTATATCgggactgcttaccggtttcccgtgtgattg > 2:67283/1‑262 (MQ=255) tCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGGATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATcg < 1:371215/288‑1 (MQ=255) aTAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTTCCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTTGCGTTTTCCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCCGGATATcggcgt > 1:465412/1‑285 (MQ=255) aaaGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGGGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑G‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGAGTTTACCCGGCGTTATATTCAGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGGGa > 1:1000175/1‑289 (MQ=255) aaaGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACGCCTGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑GCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTGACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGa < 1:892885/289‑1 (MQ=255) atgTCATACCCGTTGCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGa < 2:304295/285‑1 (MQ=255) aGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTTGAGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TCACACATCCGCTTGCTCC‑GCAGGCCG‑G‑TTTTTTCGGAAATGGCGCCTTGGCCG‑TTGGGGTTTTCAAGGAGGTTTAACAGGCAGA‑GTTTCCGGTTCCGCAGGgtatttcggggtgt > 2:724439/1‑279 (MQ=255) gTCATACCCGTATCGCCTGTATTCCCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATTCGCCCACGGC‑CATCACAACCGCTGCGTCC‑TCCGGGCG‑A‑CTTTGCCCGAAATGACTCTACGGCTG‑TGTGCGTTTTCCCGGGGGTATATCGGGCAGC‑GGTCAAGGTTCTGCAGGatttacgcgggttgtg > 2:551416/1‑275 (MQ=255) gTCATACCCGTAACGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGTTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTTGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTAACGCT‑ATGCGCCAACAGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCAATGGCTG‑t < 1:1051968/226‑1 (MQ=255) aTACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGGCGCT‑ATGCCCGAACTGC‑CATTACAACCGCTGCGTCC‑CCTGGCCC‑T‑CTTTTCCGGAAACAAACATATGGCTC‑TCGGCCGTTTCCCCGCGCTATATCCGCCACA‑GTTACAGGtttaccaggactaatcgggggttggccc > 2:494827/1‑263 (MQ=255) aTACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CCTTTCCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCCGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTa > 1:411306/1‑289 (MQ=255) ccGTAGCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCa < 1:555527/247‑1 (MQ=255) tATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGGTTGACGCT‑ATTCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTTCGCAGGATATCGCGGGGAGTGGGTATGACGat > 1:1090507/1‑289 (MQ=255) ccTGGATGACCGGCCCGCTGGGTAAAACTCCGGCGCGGCTGCGGTTGGAATGTAATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACAGTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAGTTTACCGGCGTGTTTGACGCT‑ATGCGCCTACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAAAGACGCTATGGCTG‑TTGGCATTTACCAGGCGTTAGATCACGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGGCGATATCg < 2:350208/288‑1 (MQ=255) tGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTTTCGCT‑ATGGCCCCACTGC‑CATCACATCCGCTGCCTCC‑CCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACCCCATGGCGGTTTGGCG‑TTACCCGGCCTTATTACCGGCACG‑GTTACAGGTTCCGCACGCTATCCCGGTGATTGCCTATGCCGCTATTGAAc > 2:92832/1‑289 (MQ=255) ttcccGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TTTCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGc < 2:936954/286‑1 (MQ=255) ttACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGc < 1:395609/289‑1 (MQ=255) ttACCGGCCCGCTGGAGAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑GATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGc < 1:864483/289‑1 (MQ=255) tACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCa < 1:874306/289‑1 (MQ=255) cTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTTACGCCGGGTTTGACGCT‑TTTCGCCAACTGC‑TTACTCTTTCCCCCCGCCC‑TCAGGCCC‑T‑CTTTTTCACAAATTACACCCTGGCTG‑TTTGCGTTTATCAGTCGTCATTACAAGCAGA‑GTTCAAGGTTCCGCATGAGATCGCGGGGATCTGCTTTGAccgtaactgactagtaaatcttttg > 2:888081/1‑264 (MQ=255) ataagagcccGGCGCTCCTGTGTTTGTAAGGTGATCGGGCGGCGATGAAACGTTCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTAGGAAGTCACTGATGATTTTTAAATTAACGGCGGGGTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGTTATGGCTG‑TTGGTGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGTATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGc < 1:638099/280‑1 (MQ=255) aTAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGc < 1:206530/288‑1 (MQ=255) ccGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTaa < 1:701239/289‑1 (MQ=255) cGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAAGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGAGATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCCAACTGGCAAACTTTATTACGCCCACATTaa > 1:83076/1‑288 (MQ=255) ttATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAg < 1:310173/287‑1 (MQ=255) tATCGGGCGGAGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTCATTTTGAATTTCACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGATg < 1:601390/289‑1 (MQ=255) atcgggCGGGTCTCAAACTGCCTTATGGCTATGAAGGAACTGTTAGTTGTGAATTTACCGGCGCGTTTGCCCCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATTACATCAGCTGCGTCC‑GCAGGCCG‑T‑CTGTACCGGAAATGACGCTTGGGCTG‑TTGGTGTTTACCAGGCGTTATATCAGTCAGA‑GTTGCAGGTGCCGCGGTATACCGCGGTGATTTGATATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTATC‑CACTATGTACCAACCGAAAGATGACCTGGGGGAGCTGGc < 2:643559/284‑1 (MQ=255) aaCGGGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGc < 1:976415/289‑1 (MQ=255) cGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGa < 1:182634/289‑1 (MQ=255) cGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGa < 2:702402/289‑1 (MQ=255) cGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGCCGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTCCCAGGCGTTTTATCAGGCAGA‑GGTACAGGTTCCGCAGGGTATCGCGGGGATTGGCCATGACGATATCGAACTGGCAAACGTTATGGCGCCACCATTAAC‑CACTATCCCCCAAACCAAAGATGGACTtggggggacggggcttga > 2:395926/1‑276 (MQ=255) cGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CCTTACCGGAAAAGACGCTATGGCGG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GGTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGAAATCGAACTGGCCAGCTTTATGAAGCCACCATTAACACAC‑ATCACCCAACCGAACAATGAACGGGGGGAGCTGGCGATTGa > 2:789575/1‑289 (MQ=255) tgccTGATGGCTATGAAGTGACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACAGC‑TATCACTTCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTcatcca < 2:219604/287‑1 (MQ=255) aTGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAAATGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGAAGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTAACAGGCGTTATATCAGGGAGA‑GGTACAGGTTTCGGAGGATATCGCGGTGATTGGGTATGACGAGATTGAAATGGCAAGCTTTAATACGGCCACATTAAC‑CAATAACCACCAACCGGAAAAAGAACTCGGGGGGCGGGGGACTGAATTACttaacacacggat > 2:419646/1‑277 (MQ=255) tATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑CTGCGCCCACTGC‑TATCACATCCCCCGCGTCC‑TTCGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATTACGCCATGGCTG‑TTGGCGTTTATCAGGCGTTTTAACAGGCATA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGTGGGGATTGTCTACTACGATATCGAACTGGCAACCTTTATTACGCCACCCTTACC‑CAACATTCACCAACCGAAAGATGAATTGGGGGAGCTGGGGCTTTATGGACTTATTCCTAGGATAAcc > 2:1190294/1‑288 (MQ=255) tGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CCTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCCGGAAATCGCGGGGATTGGCTATGAAGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGATGAACAGGGGGAGCTGGGGATTGATGTACTCATTCATAGGATAAcccc > 2:864507/1‑287 (MQ=255) aaGTCACTTTGGATTTTTACTTAACCGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TCACACATCCTCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTCCCGGAAATGACGCTATGTCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGGGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGATGCACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGcc < 2:969197/289‑1 (MQ=255) aCTGGTGATTTTGGATTTAACGGCGTGTTTGACGCT‑ATGCTCCAACTTC‑TATCACTTCCGCTACGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGAccc < 1:1242897/289‑1 (MQ=255) ttttGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATTACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGGTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCCGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAAATGGCCAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAAACGAAAGATGAACTTGGGGCGGCGGGGATTGATTTACTCATCCAACGGATAAACCAACCGACCCTTCAGaaa > 2:1105109/1‑289 (MQ=255) ttGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGACCCTTCAGcaaca < 1:499611/289‑1 (MQ=255) ttGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGACCCTTCAGcaaca < 1:101015/289‑1 (MQ=255) aaCGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCCACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAgg > 2:845955/1‑124 (MQ=255) aaCGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAgg < 1:845955/124‑1 (MQ=255) cggGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GGTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGCCGCTATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCCTTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGAATAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTTCTTATTCATCGGATAAACCAACCGACCCTTGAGCAACACCGATaacaacct > 2:741923/1‑287 (MQ=255) | TGAAATCATGCAACGTTATCCGACAGTGCCTACTGTGATGATGGACTGGGCTCCGTTCGATGGCGACAGCGATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCT‑ATGCGCCAACTGC‑TATCACATCCGCTGCGTCC‑TCAGGCCG‑T‑CTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTG‑TTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGA‑GTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAAC‑CACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGACCCTTCAGCAACAACGATTACAACTTACTCC > NC_000913/3938618‑3939190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |