| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 2553460 | 149 (0.880) | 3 (0.020) | 3/496 | NT | 2.0% | coding (238/900 nt) | hemF | coproporphyrinogen III oxidase |
| ? | NC_000913 | = 2553466 | 151 (0.920) | coding (244/900 nt) | hemF | coproporphyrinogen III oxidase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
ATTTCCACTGGTTCGACAACCAGAAAGCACATTCGAAAAAGCGATAAGTTATGAAACCCGACGCACACCAGGTTAAACAGTTTCTGCTCAACCTTCAGGATACGATTTGTCAGCAGCTGACCGCCGTCGATGGCGCAGAATTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGTGACCTGTGCCTGCCATTTGGCGAAGACGTTTATCCCCGTTACAAAAAGTGGTGCGACGAATACTTCTACCTCAAACATC > NC_000913/2553173‑2553748 | aTTTCCACTGGTTCGACAACCAGAAAGCACATTCGAAAAAGCGATAAGTTATGAAACCCGACGCACACCAGGTTAAACAGTTTCTGATCAACCTTCAGGATACGATTTGTCAGCAGCTGACCGCCGTCGATGGCGCAGAATTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCCGCGGCGGGCGGAGTCGGGTGTTGAGTAATGGGGGAGTCTTCGAACAGGGAGGCGTCAACTTTTCGCACGTCACCGGTAAGGTGATGCCGGCTACCGCCACCGGTCATCGCGCGG > 2:375693‑M1/1‑288 (MQ=255) 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ATTTCCACTGGTTCGACAACCAGAAAGCACATTCGAAAAAGCGATAAGTTATGAAACCCGACGCACACCAGGTTAAACAGTTTCTGCTCAACCTTCAGGATACGATTTGTCAGCAGCTGACCGCCGTCGATGGCGCAGAATTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGTGACCTGTGCCTGCCATTTGGCGAAGACGTTTATCCCCGTTACAAAAAGTGGTGCGACGAATACTTCTACCTCAAACATC > NC_000913/2553173‑2553748 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |