| New junction evidence | |||||||||||
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GCGCTGAAGCTGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTGAAGAGGTGTTTTCAGTTCTGTTCGACAACCCATTCCTGCATACCACCACCTTTGGCGGCAACCCGCTGGCCTGTGCGGCGGCGCTGGCGACCATC > NC_000913/3219960‑3220532 | gcgcTGAAGCGGGCGAAAGATTACCAGGCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCAGGGTAAATAACTGGGCGGGCGGTCGGCCAAGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGc < 2:1296589/288‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |