| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4433500 | 190 (1.120) | 3 (0.020) | 3/506 | NT | 1.6% | coding (526/861 nt) | qorB | NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
| ? | NC_000913 | 4433504 = | 188 (1.120) | coding (522/861 nt) | qorB | NAD(P)H:quinone oxidoreductase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
TGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTG‑CCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATCGCCCGCCGCACCGATAAATACGCCGTGTTCCAGTGCTGCCGGGGCGCTGGCGAGGTAGTTTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACG > NC_000913/4433216‑4433788 | tGGGTGGCCAATACATTTGCTAAGTGTTTGGCTCTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACCGCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGGCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTG‑CCGCAGCTGCCGCa < 2:312531/289‑1 (MQ=255) gggTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTG‑CCGCAGCTGCCGCAt > 1:783599/1‑289 (MQ=255) ggCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTG‑CCGCAGCTGCCGCATaa > 1:1034097/1‑287 (MQ=255) gCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTG‑CCGCAGCTGCCGCATCATCt > 1:736675/1‑289 (MQ=255) gCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCGCTGCCGCCAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCGAATCACGCGTC‑CCGCACCTGCCGCCTaa > 2:1082183/1‑286 (MQ=255) ccAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTG‑CCGCAGCTGCCGCATAATCt < 2:1497228/288‑1 (MQ=255) tcaatTTGCTAAGTGTTTTGCTTTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTG‑CCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCcg < 1:1579545/289‑1 (MQ=255) tcaatTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTG‑CCGCAGCTGCCGCAAAATCTGCAcg > 1:582949/1‑289 (MQ=255) aaGTGTTTTGCGGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTG‑CCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAg < 1:1422923/289‑1 (MQ=255) tGCTGTCTTCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTG‑CCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGAtttt > 1:19226/1‑289 (MQ=255) 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tcatcaAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCACTCCGTCGGGCCGTCCGACGCTTTTCAGTCCCGCGGCGAAATCGGCCTCGCTCCGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTTCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGGG‑CCGAAGCTGCCGCCTAATCTGCCCCCGTTGCTGCGTCGATTTTTCCa > 2:1229097/1‑288 (MQ=255) catcaAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGCTTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTG‑CCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGATTTTGCCATc < 2:1223735/289‑1 (MQ=255) atcaAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTATGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTCATCACGCGTG‑CCGCAGCTTCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCGGAGGCGATTTTGCCATc > 1:1408710/1‑288 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |