| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2972362 | 141 (0.830) | 8 (0.050) | 8/510 | NT | 5.3% | coding (768/1041 nt) | tas | putative NADP(H)‑dependent aldo‑keto reductase |
| ? | NC_000913 | 2977089 = | 145 (0.860) | coding (493/1032 nt) | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor, autorepressor | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGG‑CGAACCAGACGAAAGCGGCGGCGAACAGGCAATGACCGAGCTTTTGGGACGAGGAAGAAATTTCACTGCGGTAGCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTA > NC_000913/2976813‑2977377 | ttttCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTGGGTCGTCCATGCAAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAAcgcg < 1:1292195/289‑1 (MQ=255) tttCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGTTGCCTGGCTGGCAAcgcg > 1:1301295/1‑288 (MQ=255) tGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGCCACCGCGTCATTTa > 1:1298625/1‑289 (MQ=255) aaaGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAg > 1:527717/1‑289 (MQ=255) tCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATa > 1:902436/1‑288 (MQ=255) cGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATAc < 1:1494944/288‑1 (MQ=255) cGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGATGATCACCCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATAc > 1:22267/1‑288 (MQ=255) 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tCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGCAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACAGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCTTTGTATTGCGCTGGACGCTCGTCACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTGATATCATTCAGCCAGTGCCTACCCGCATTGTTtctc > 2:854579/1‑287 (MQ=255) acCGGGAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGct < 1:1539528/289‑1 (MQ=255) ttATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTa > 1:649224/1‑289 (MQ=255) tATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTAt > 1:550241/1‑289 (MQ=255) gattgGCAACGGGTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCCCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGGTCCCGGATGCTTATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCGGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCt < 2:1369553/289‑1 (MQ=255) ttgGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTg < 1:1537911/288‑1 (MQ=255) 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ccTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGG‑CGAACCAGACGAAAGCGGCGGCGAACAGGCAATGACCGAGCTTTTGGGACGAGGAAGAAATTTCACTGCGGTa < 1:1140918/233‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGG‑CGAACCAGACGAAAGCGGCGGCGAACAGGCAATGACCGAGCTTTTGGGACGAGGAAGAAATTTCACTGCGGTAGCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATaa > 2:1140690/1‑286 (MQ=255) ccTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGG‑CGAACCAGACGAAAGCGGCGGCGAACAGGCAATGACCGAGCTTTTGGGACGAGGAAGAAATTTCACTGCGGTAGCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATgg > 2:1446834/1‑289 (MQ=255) tggctggcAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGG‑CGAACCAGACGAAAGCGGCGGCGAACAGGCAATGAcc > 1:365575/1‑195 (MQ=255) | TTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGG‑CGAACCAGACGAAAGCGGCGGCGAACAGGCAATGACCGAGCTTTTGGGACGAGGAAGAAATTTCACTGCGGTAGCCTGTTATAACGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTA > NC_000913/2976813‑2977377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |