| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,424,488 | T→A | 2.5% | F236Y (TTT→TAT) | trkG → | Rac prophage, potassium transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,424,488 | 0 | T | A | 2.5% | 603.3 / 3.3 | 158 | F236Y (TTT→TAT) | trkG | Rac prophage, potassium transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (74/80); new base A (2/2); total (76/82) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
AGGTGGTTTAGGAGTTATTGTTCTGGCGGTTGCTGTATTGCCATTATTGGGTATTGGTGGTGCAAAGCTTTATCAGTCAGAAATGCCGGGGCCATTTAAGGATGACAAACTCACTCCCCGCCTGGCCGATACGTCACGGACACTGTGGATAACTTATTCTTTATTAGGTATTGCTTGTATTGTCTGTTATAGACTTGCAGGAATGCCTTTGTTTGATGCTATTTGTCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCA‑TAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTGGTATATTGTTATTAGCAGGAAAACGATAAAACCTTTAATCAGAGATATTGAACTTCGTTTCTTTCTGTTAATAGCCTTAGGGGTGATCATTGTTACCTCTTTCCAGGTCTGGCATATAGGTATGTATGACTTGCATGGAAGTTTTATTCATTCGTTTTTTCTTGCCAGCTCCATGCTCACTGATAATGGTTTAGCTACGCAGGATTATGCAAGTTGG > NC_000913/1424201‑1424774 | aGGTGGTTTAGGAGTTATTGTTCTGGCGGTTGCTGTATTGCCATTATTGGGTATTGGTGGTGCAAAGCTTTATCAGTCAGAAATGCCGGGGCCATTTAAGGATGACAAACTCACTCCCCGCCTGGCCGATACGTCACGGACACTGTGGATAACTTATTCTTTATTAGGTATTGCTTGTATTGTCTGTTATAGACTTGCAGGAATGCCTTTGTTTGATGCTATTTGTCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCA‑TAGCGAGAGTATCGGATAtttt < 1:605077/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |