| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,204,384 | Δ1 bp | 4.2% | intergenic (+97/‑210) | yehK → / → yehL | uncharacterized protein/putative hexameric AAA+ MoxR family ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,204,384 | 0 | T | . | 4.2% | 337.0 / 4.8 | 94 | intergenic (+97/‑210) | yehK/yehL | uncharacterized protein/putative hexameric AAA+ MoxR family ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/41); new base . (2/2); total (50/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTCCAACATTTCATCAACGTGATCGAGAAGATGCTGACCCGCTAATAAATGATGCGTTGATTTATATAAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCTCACCAGCAGGTTTTTTTATTTACTGTGATCTGCTTTCCAGATATTTTTCGCTCAAACAACTAATGCGCCAAACATTTATTGCGCGTAAAATATCGTTTATTTCATTAATACATTTCAGGGATGAATATATGTCACCGCAGAATAATCATCTGCAGCGTCCGCCTGCTGCTGTGTTATACGCCGATGAACTGGCAAAATTAA > NC_000913/2204112‑2204666 | gTCCAACATTTCATCAACGTGATCGAGAAGATGCTGACCCGCTAATAAATGATGCGTTGATTTATATAAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAAttcgttcg > 1:602142/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |