| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1314673 = | 89 (0.700) | 3 (0.020) | 3/492 | NT | 3.5% | intergenic (+15/+45) | ompW/yciE | outer membrane protein W/putative rubrerythrin/ferritin‑like metal‑binding protein |
| ? | NC_000913 | 1314694 = | 80 (0.650) | intergenic (+36/+24) | ompW/yciE | outer membrane protein W/putative rubrerythrin/ferritin‑like metal‑binding protein | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
AGGTATTAACTACACCACCTTCTTTGATAATGGATTTAACGATCATGGCAAAGAGGCAGGGCTTTCCGATCTCAGTCTGAAAGATTCCTGGGGAGCTGCCGGGCAGGTGGGGGTTGATTATCTGATTAACCGTGACTGGTTGGTTAACATGTCAGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACA‑GCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTAAAATCGCTTCGATGGTTGGAATTGAAGCTGTATCACCGGCATTTTTTGCTGCTGCTAATAGTGAGGTGTAACAGGCGATTTCAAATTGCTCGAAGACATATCCGCTAATAGAGCCTTTGACTATTTCATCAGAAGG > NC_000913/1314388‑1314960 | aGGTATCAACTACACCACCTTCTTTGATAATGGATTTAACGATCATGGCAAAGAGGCAGGGCTTTCCGATCTCAGTCTGAAAGATTCCTGGGGAGCTGCCGGGCAGGTGGGTGTTGATTATCTGATTAACCGTGACTGGTTGGTTAACATGTCAGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACA‑GCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGAcc < 2:779727/289‑1 (MQ=255) tcaatcggtggtatattcccttctgatgaaatagtcaaaggctctattagcggatatgtcttcgagcaatttgaaatcgcctgttacacctcactattagcagcagcaaaaaatgccggtgatacagcttcaattccaaccatcgaagcgattttaaatgaggaaaagcaaatggccgactggctgattcagaatattccgcaaacaactgagaaatttttaattcgctctgaaactgatggcgtagaagcgaagaaataataccctttataccatgtccttattGAc < 1:636730‑M1/3‑1 (MQ=255) tcaatcggtggtatattcccttctgatgaaatagtcaaaggctctattagcggatatgtcttcgagcaatttgaaatcgcctgttacacctcactattagcagcagcaaaaaatgccggtgatacagcttcaattccaaccatcgaagcgattttaaatgaggaaaagcaaatggccgactggctgattcagaatattccgcaaacaactgagaaatttttaattcgctctgaaactgatggcgtagaagcgaagaaataataccctttataccatgtccttattGAc < 1:1152197‑M1/3‑1 (MQ=255) ggTATTAACTACACCACCTTCTTTGATAATGGATTTAACGATCATGGCAAAGAGGCAGGGCTTTCCGATCTCAGTCTGAAAGATTCCTGGGGAGCTGCCGGGCAGGTGGGGGTTGATTATCTGATTAACCGTGACTGGTTGGTTAACATGTCAGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACA‑GCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGAcc > 1:1051262/1‑288 (MQ=255) 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caccacCTTCTTTGATAATGGATTTAACGATCATGGCAAAGAGGCAGGGCTTTCCGATCTCAGTCTGAAAGATTCCTGGGGAGCTGCCGGGCAGGTGGGGGTTGATTATCTGATTAACCGTGAATGGTGGGTTAACATGTCAGTGTGGTACATGGATATCGATACAACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACA‑GCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGGTCTCAGCAGGTTAACGTTTTTAATTCCGCACAAACACGACCCCGTAATATACg > 1:874900/1‑289 (MQ=255) caccacCCTCTTTGATAATGGATTTAACGATCATGGCAAAGAGGCAGGGCTTTCCGATCTCAGTCTGAAAGATTCCTGGGGAGCTGCCGGGCAGGTGGGGGTTGATTATCTGATTAACCGTGACTGGTTGGTTAACATGTCAGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACA‑GCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGAcc > 1:24919/1‑277 (MQ=255) accaccTTCTGTGATAATGGTGGTAACGTTCAGGGCAAAGAGGCAGGGCTTTCCGATCTCAGTCTGAAGGGTTCCTGGGGAGCAGCCGGGCAGGTGGGGCGTGCTTATCGGATTAGGCGTCACTGGTTGGTTAACTTGTCGGTGGGGTACATGGCGACAGATACCACCGCCAGTTATAACCTGGGCGGT‑CACACGCAAAACGATAGCGGACGCTTCGAACCGTGGGGGGTTATGATAACAGGAGGATATGGTTTTTATTTCCGAAAAAAAACGACAGCGTAATATCCgg > 2:375517/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |