| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3419953 = | 143 (1.120) | 5 (0.040) | 3/494 | NT | 3.6% | pseudogene (849/960 nt) | yhdW | pseudogene, ABC transporter periplasmic binding protein family,putative transport, Not classified, putative periplasmic binding transport protein, periplasmic‑binding component of ABC superfamily |
| ? | NC_000913 | 3420126 = | 127 (1.030) | intergenic (+62/‑6) | yhdW/yhdX | pseudogene, ABC transporter periplasmic binding protein family,putative transport, Not classified, putative periplasmic binding transport protein, periplasmic‑binding component of ABC superfamily/putative amino acid ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CTGATATGGCACATCTGCTGGGTAAAGAAGGCGATTACGGCAAGGATCTGAAGCTGGATAATAAATGGGCCTATAACATCATCAAACAGGTGGGTAACTACTCGGAAATTTTTGAGCGTAACGTAGGTTCAGAAAGCCCGCTGAAAATTAAACGTGGGCAAAATAATCTCTGGAATAACGGCGGTATTCAGTACGCACCGCCCGTGCGTTAAGTCGGTGTGAGGTAACGAGCGTCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGATCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCGGTATTGTCCAGCATTTGATCGATTACCAGCAGGGCGACACCTACGGACGCGTTTTTATTGTCGGCTTACTCAATACGCTA > NC_000913/3419853‑3420407 | gCACATCTGCTGGGTAAAGAAGGCGATTACGGCAAGGATCTGAAGCTGGATAATAAATGGGCCTATAACATCATCAAACAGGTGGGTAACTACTCGGAAATTTTTGAGCGTAACGTAGGTTCAGAAAGCCCGCTGAAAATTAAACGTGGGCAAAATAATCTCTGGAATAACGGCGGTATTCAGTACGCACCGCCCGTGCGTTAAGTCGGTGTGAGGTAACGAGCGTCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCa > 1:150401/1‑289 (MQ=255) 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tCTGCTGGGTAAAGAAGGCGATTACGGCAAGGATCTGAAGCTGGATAATAAATGGGCCTATAACATCATCAAACAGGTGGGTAACTACTCGGAAATTTTTGAGCGTAACGTAGGTTCAGAAAGCCCGCTGAAAATTAAACGTGGGCAAAATAATCTCTGGAATAACGGCGGTATTCAGTACGCACCGCCCGTGCGTTAAGTCGGTGTGAGGTAACGAGCGTCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGt > 1:1110703/1‑262 (MQ=255) agaagGCGATTACGGCAAGGATCTGAAGCTGGATAATAAATGGGCCTATAACATCATCAAACAGGTGGGTAACTACTCGGAAATTTTTGAGCGTAACGTAGGTTCAGAAAGCCCGCTGAAAATTAAACGTGGGCAAAATAATCTCTGGAATAACGGCGGTATTCAGTACGCACCGCCCGTGCGTTAAGTCGGTGTGAGGTAACGAGCGTCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCAc > 1:661400/1‑288 (MQ=255) gggATTACGGCAAGGAGCTTAATCTGGATAATCAATGGGCCTATAACATCATCAAACAGGTGGGTAACTACTCGGAAATTTTTGAGCGTAACGTAGGTTCATAAAGCCCGCTGAAAATTAAACGTGGGCAAACTAATCTCTGGAATAACGGCGGTATTCAGTACGGCCCGCCCGTGCGTTAAGTCGGTGTGAGGTAACGAGCGTCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCActctct < 2:635617/286‑1 (MQ=255) 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tccgagGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGATCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCGGTATTGTCCAGCATTTGATCGATTACCAGCAGGGCGACACCTACGGACGCGTTTTTATTg > 1:1005392‑M2/7‑268 (MQ=255) tccgagGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGATCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCGGTATTGTCCAGCATTTGATCGATTACCAGCAGGGCGACACCTACGGACGCGTTTTTATTGTCGGCTTACTCAATACGCTa > 2:731989‑M2/7‑288 (MQ=255) | CTGATATGGCACATCTGCTGGGTAAAGAAGGCGATTACGGCAAGGATCTGAAGCTGGATAATAAATGGGCCTATAACATCATCAAACAGGTGGGTAACTACTCGGAAATTTTTGAGCGTAACGTAGGTTCAGAAAGCCCGCTGAAAATTAAACGTGGGCAAAATAATCTCTGGAATAACGGCGGTATTCAGTACGCACCGCCCGTGCGTTAAGTCGGTGTGAGGTAACGAGCGTCGCTACGGCGGCGCTCTCTTCAGCGTTATGCTTTCCGAGGTTTCTATGTCTCATCGCCGCTCAACCGTTAAAGGCTCACTCTCTTTTGCCAACCCTACGGTTCGCGCCTGGTTATTCCAGATCCTTGCCGTTGTTGCTGTTGTCGGCATTGTTGGTTGGTTATTTCACAACACTGTAACGAATCTCAATAATCGTGGCATTACTTCAGGTTTTGCCTTTCTGGATCGCGGCGCTGGCTTCGGTATTGTCCAGCATTTGATCGATTACCAGCAGGGCGACACCTACGGACGCGTTTTTATTGTCGGCTTACTCAATACGCTA > NC_000913/3419853‑3420407 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |