| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4436130 | 136 (1.060) | 3 (0.020) | 3/504 | NT | 2.0% | coding (437/1944 nt) | cpdB | 2':3'‑cyclic‑nucleotide 2'‑phosphodiesterase |
| ? | NC_000913 | = 4436331 | 166 (1.310) | coding (236/1944 nt) | cpdB | 2':3'‑cyclic‑nucleotide 2'‑phosphodiesterase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
AATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCCAGCGGACTC‑CCCTGAATCAAATCGCCGTTATCAACCAGTACGCTGTTTTTCACTTCATTGCGGGCATCGTTAATCAGGCTTGCCGTACGTACCAGTCCGAATTTTTCCGTGGCGGTGTCTTTGTAATAATCGAAATCCATCATGTTGCTATGCAGATCAGTGGTTTCCATGATACGCAGATCGACCGTCGCTGCATTCACACTGGCGGCAATCAGCGTGGCCAGGAGCGTTGCGCTAAACTTAATCATCAGGGACATCCTTTTATCATCGGGAATACGAAAGAAAAGGGAGAATAAACGTC > NC_000913/4436045‑4436619 | aTCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCCAGCGGACTC‑CCCTgaa > 1:214012‑M2/1‑286 (MQ=255) tGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTCAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGGTCTGGCGTCCATGACGTTGGCATTTACATACGGTCATTTCGCTCCTGCTAGCGCATTTGTCAGGTAATCCAGACAGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGCTCCGACGGTATAGTCCCGCGTAATTAATGCCTTATCGACCGGGTGAATATCCCCTGC‑TTTTAATCATTTGGCCGACATGTAATCGGCCAGCTG‑CTCTCCCTgaatcaaacagccgt < 2:1117872‑M2/289‑16 (MQ=255) gTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCTTTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTATTCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCCAGCGGACTC‑CCCTGAATCAAATCGCCGtt > 1:400696/1‑289 (MQ=255) ttCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATTCGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCCAGCGGACTC‑CCCTGAATCAAATCGCCGTTATCAAc < 1:968826/289‑1 (MQ=255) ttCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCCAGCGGACTC‑CCCTGAATCAAATCGCCGTTATCAAc < 1:1151329/289‑1 (MQ=255) tttATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCCAGCGGACTC‑CCCTGAATCAAATCGCCGTTATCAACCAGTACg < 1:159133/289‑1 (MQ=255) tttAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCAAGCGGACTC‑CCCTGAATCAAATCGCCGTTATCAACCAGTACGATTCTTTTCACTTCATTGccg > 2:631567/1‑287 (MQ=255) 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AATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGC‑TTTTAATCCTTTCGCCGACATGTAATCGGCCAGCGGACTC‑CCCTGAATCAAATCGCCGTTATCAACCAGTACGCTGTTTTTCACTTCATTGCGGGCATCGTTAATCAGGCTTGCCGTACGTACCAGTCCGAATTTTTCCGTGGCGGTGTCTTTGTAATAATCGAAATCCATCATGTTGCTATGCAGATCAGTGGTTTCCATGATACGCAGATCGACCGTCGCTGCATTCACACTGGCGGCAATCAGCGTGGCCAGGAGCGTTGCGCTAAACTTAATCATCAGGGACATCCTTTTATCATCGGGAATACGAAAGAAAAGGGAGAATAAACGTC > NC_000913/4436045‑4436619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |