Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,304,520 | 0 | G | T | 6.6% | 280.8 / 6.3 | 98 | intergenic (+129/+586) | eco/mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/40); new base T (4/3); total (54/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
AAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGTAT‑ACGCCAGACAATGTAGATGTGAAGTACCGCGTCTGGAAGGCGGAAGAGAAAAT‑TGACAACGC‑GGTAGTTCGCTAAACTGCCGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGG‑TCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGT > NC_000913/2304233‑2304806 | aagaaagaGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGTAT‑ACGCCAGACAATGTAGATGTGAAGTACCGCGTCTGGAAGGCGGAAGAGAAAAT‑TGACAACGC‑GGTAGTTCGCTAAACTGCCGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCg > 2:340967/1‑288 (MQ=255) aagaaagaGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGTAT‑ACGCCAGACAATGTAGATGTGAAGTACCGCGTCTGGAAGGCGGAAGAGAAAAT‑TGACAACGC‑GGTAGTTCGCTAAACTGCCGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCg > 2:280793/1‑288 (MQ=255) tgagaaaaTTGGTCACCGGGTATCGGAGCGAGTGTGGAAGACGGCGTTACAACGGCAAGCTGCCGATCGTGGTGAGT‑ACGCCAGACAATGTGGATGTGAAGAAGCGCGTCTGGGAAGCGGAAGAGAAAAT‑GGACAACGC‑GGAAGTTCGCTAAACTGCCGTGAAGTGCGGCACCCGGTAGTTCATGCAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGATCCGGTTGCCTGATGCTACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCg < 2:228571/284‑1 (MQ=21) aagaaATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGTAT‑ACGCCAGACAATGAAGATGTGAAGTACCGCGCCTGGGAGGCGGAAGAGAAAAT‑TGACAACGC‑GGTAGTTCGCTAAAATGCCGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACCAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTGGCCTGATGCGACGCCGGCGCGTCGTCTCATGCCCACCTCCCGGTGACGTGCTGCCACCCgca > 2:225171/1‑287 (MQ=37) 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cTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGG‑TCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCAACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGt > 1:23464/1‑288 (MQ=255) cTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGG‑TCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGCCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGACGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGCCATCTAACGCCCAAGCCGGTTGTCTGCTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGGAGTGCTCCAACCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCAACCGa > 1:765823/1‑278 (MQ=255) cTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGG‑TCACGCCGCATCCGACATACAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGt > 1:821900/1‑288 (MQ=255) cGGCCCCCCGTGGGTCAGACAAGGCGG‑GCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGGGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGGGTCTTATCAGGCCTACAAAGCTGTGAAGTGCTCCACACCGTAGGTCGGATAAGGGGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGt < 1:1181450/288‑1 (MQ=255) cGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGG‑TCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAgg < 1:25384/127‑1 (MQ=35) cGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGG‑TCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAgg > 2:25384/1‑127 (MQ=35) | AAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGTAT‑ACGCCAGACAATGTAGATGTGAAGTACCGCGTCTGGAAGGCGGAAGAGAAAAT‑TGACAACGC‑GGTAGTTCGCTAAACTGCCGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGG‑TCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGT > NC_000913/2304233‑2304806 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |