| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,304,686 | A→G | 6.0% | intergenic (+295/+420) | eco → / ← mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,304,686 | 0 | A | G | 6.0% | 209.9 / 2.5 | 88 | intergenic (+295/+420) | eco/mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/38); new base G (2/5); total (44/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
TGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCG‑GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAG‑GCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAC > NC_000913/2304399‑2304958 | tGAAGTGCGGCACCGCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGGGCCG‑GTTTCCGGATGCGACGCTGGAGAGTCTTATCAGGCCTTCACCGCTGTGAAGTTCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACCCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCa < 1:111149/288‑1 (MQ=255) cGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCG‑GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAACAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAACGCCGTTACGCCGAATCCGCCATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGac > 2:54733/1‑287 (MQ=255) cAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCG‑GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATTCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGCAGTGCCCCACCCCGTAGGTCGGAGAAGGCGGTTACGCCCCAACCGACATCTAACGGCCAAGCCGGTTGCCTGTGGCGAc > 2:905482/1‑286 (MQ=255) aGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCG‑GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCCCCACCCCGTAGGTCGGAAAAGGCGGTTACGCCGCATCACACATCCAACGCCCAAGCCGGTTGCCCGATTCCACCCTg > 2:1227063/1‑289 (MQ=255) aCAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCG‑GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGCCGCTGgc > 1:1213980/1‑289 (MQ=255) aCAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCG‑GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCCCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAACCGGTTGCCTGATGCGACGCCGgc > 1:1123527/1‑289 (MQ=255) ggCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCG‑GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCACGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGcgcg > 1:242437/1‑288 (MQ=255) gCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCG‑GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGCTTCCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAAGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTCGGTCGGCTAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACACCCACCCCCCACGCCGGCTGCCTGATGCGACGCTCgcgcct > 1:268530/1‑286 (MQ=14) gtactcaggatccgtcttcttacccccGAGACG‑ATTGCCTTGTGCGACGCTGGCACGTCTGTTCACGCGTACACCTCTGTGACGTGCGGCACCGCGTAGGTCATACAAGGCGGTCACGCCACATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt < 2:1069839/265‑1 (MQ=11) gaccccgcACCGGAGACCCAACGCGCGGGCCG‑ATGGCCGGATGCGCCGCTGTGGCGTCTTATCAGCCCTACCCCGCTGTGAAGGGCGGCTCCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt < 2:255845/284‑1 (MQ=14) 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cATCCGACATCCAACGCCCGAGCCG‑GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGCTTGCCTTATGCCACGCTGGCGCGTCCTATCAGGCCTACCCCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGAGCAGGCGGTTACGCCGCATCCGCCCTCCAACCCCCAAGCCGACTCCCTGCTGCTAGCCTGAGGCGTCCTAGCAGGcca > 2:309343/1‑287 (MQ=11) cATCCGACATCCAACGCCCAGGACG‑GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTAAACCGCTGTGAAGGGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTa < 1:640588/289‑1 (MQ=255) ggaaggccaccgcaggggCCG‑GGTGCCGGAGGCGACGCTGGCGCGAGATAACAGGCGGACACCGCGGTGAAGTGCGGCACCCCGTGGGTCAGAGAAGGCGGGCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTGATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTaca < 2:588707/270‑1 (MQ=11) gaaccgcggggCCG‑GGTGCCGGAGGGGAAGCGGGCGCGTGCGAGTAGGACTACACCGCGTGGAAGGGCGGAACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCAGGCCGCATCGGCATTCCACCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTGTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGGGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtgtg < 2:596103/278‑1 (MQ=11) aaCGCCCGAGCCG‑GTTGCCTGAGTCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCGGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGaa < 1:668444/289‑1 (MQ=255) taagcccgaccgggggggcgaaTGCGACGATGAGGCGTCTTAGCGGCACTAAACCGCGGTGAAGAGCGGAACCCCGTAGGCCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCATGATGCGAGGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCGGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGaa < 2:1015113/268‑1 (MQ=11) cggAGCAG‑TTTGCCGGAGGCAACGGTGGCGGCTCTTGTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGGGCGGGACCACGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACAGCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCt < 1:42913/287‑1 (MQ=11) cgagccggatggcgaagcggaggCTGGCGAGTCTTGTCAGGCCTAGCGCGCGGTGAAGTGCGTCGCCCCTACGGTCGGACAGGGCGGTCACGCTGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGAGGCGACGCTGGGGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAGCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTc < 2:1407158/267‑1 (MQ=11) g‑gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCCTCTGATCAGGCCTAGACCGCGGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc < 1:783228/289‑1 (MQ=255) cTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGaa > 1:880719/1‑241 (MQ=39) cacCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCTTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTaca > 1:399604/1‑228 (MQ=255) cTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAG‑GCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGt > 1:293048/1‑288 (MQ=40) 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tgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGACCGAGCCGGTTGCCTGGTCAGACGCTGGCTCCTCCTATCACGCCTACACCCCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGCTACGGCCGTTACGCCGCCTCCAACACCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTCATGCGCTTCTGCCGCGTCGTATCCGCCCTCCACCGCTGTGAAGTGCTCCACCTCGTAGGCCGGACAAG‑GACGGTACGCCGAATCCAACACCCGACGTCCg > 2:944419/1‑288 (MQ=14) gAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAG‑GCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGa < 1:905482/288‑1 (MQ=255) aGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAG‑GCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGc < 1:54733/288‑1 (MQ=255) 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TGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCG‑GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAG‑GCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAC > NC_000913/2304399‑2304958 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |