| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 434,727 | T→C | 3.3% | N27N (AAT→AAC) | ribE → | riboflavin synthase beta chain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 434,727 | 0 | T | C | 3.3% | 426.5 / 3.1 | 124 | N27N (AAT→AAC) | ribE | riboflavin synthase beta chain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (65/53); new base C (2/2); total (68/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.23e-01 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CCCGCGGATTATGCACGCTGCCAGGGCTTGAGAAATTAGCCGACGCCCCCCAATTTAAATTCAAAGAGATACGTCATGTAGGCCCGGATGTTTGCCTGCATTTAGTGGGTGCATGATCTCCCGGCTCGAAAGGGAAGCAGCGCACGAAATATTATGCTAAAATCCGCCCCCCTGCGGGGCCATACTCGAACCCGAAGGAAGAAAATGAACATTATTGAAGCTAACGTTGCTACCCCGGACGCTCGCGTCGCCATCACCATCGCGCGTTTCAACAACTTTATCAATGACAGCCTG‑CTGGAAGGTGCAATTGACGCACTGAAACGTA‑TCGGTCAGGTAAAAGATGAAAACATTACCGTTGTTTGGGTGCCTGGTGCCTAT‑GAGCTGCCGCTGGCGGCGGGTGC‑ACTGGCTAAAACCGGTAAATACGACGCGGTGATTGCGCT‑GGGTACGGTTATTCGTGGTGGCACTGCCCACTTTGAATATGTCGCTGGTGGTGCAAGCAACGGCCTGGCGCATGTTGCCCAGGACAGCGAAATTCCGGTTGCTTTTGGGGTTCTGACCACTGAAA > NC_000913/434443‑435007 | ccGCGGGTTATGCACGCTGCCAGGGCTTGAGAAAGTAGCCGACGCCCCCCAAGTTAAAGGCAAAGTGATACGTCATGTATGCCCGGATGTTTGCCTGCATTTCGTCGGTGCATGAGCTCCCTGCTCGAAAGGGAAGCAGCGCACGAAATATTATGCTAAAATCCGCCCCCCTGCGGGGCCATACTCGAACCCTAAGGAAGAAAATGAACATTATTGAAGCTAACGTTGCTACCCCGGACGCTCGCGTCGCCATCACCATCGCGCGTTTCAACAACTTTATCAATGACa < 1:651601/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |