New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1580855 = | 151 (0.870) | 8 (0.050) | 4/506 | NT | 5.1% | coding (1670/1683 nt) | ydeN | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase |
? | NC_000913 | = 2290110 | NA (NA) | intergenic (‑31/+2) | insH1/yejO | IS5 transposase and trans‑activator/pseudogene, autotransporter outer membrane homology,putative transport, Not classified, putative ATP‑binding component of a transport system |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
ATAACTTTACGGAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATAAACTCTCTTACCACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTG‑TAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGA > NC_000913/1580567‑1581139 | tcgctcaggttgtaccaatgctgcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcc > 1:1445087‑M1/289‑289 (MQ=255) tcgctcaggttgtaccaatgctgcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcc > 1:568754‑M1/289‑289 (MQ=255) aggttgtaccaatgctgcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaaaatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcCTTAGTg < 1:527904‑M1/7‑1 (MQ=255) tACGGAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGG‑AAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCt > 1:1263770/1‑289 (MQ=255) aaaaTCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGATTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTg > 1:432253/1‑289 (MQ=255) aaaTCCAGGCCAGCCATAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGa < 2:233089/289‑1 (MQ=255) ggCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGtt > 1:974263/1‑289 (MQ=255) gTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGAGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCCAGCTCAATAAGGCGGCGGAAAGATACGCCGCATGAAGGTTTAGTAGTTTCGCTTCGATTAGTGCTTTCTTGATTTTGTTAAACTTCTACTGAtt > 2:1429658/1‑289 (MQ=255) ttCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGAttt > 2:547116/1‑289 (MQ=255) tCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTa < 1:810710/289‑1 (MQ=255) tGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGATTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTTCATCGCTATCTCGCTGAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGCAGGTGTAGTTATTTCGCTTCCCTTAGGGCTTTCTTGATAATGTTAAACTTCTCCTGATTTCCCATGCTaa > 2:751057/1‑289 (MQ=255) agcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcc < 2:1566555‑M1/1‑1 (MQ=255) tAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATTCGCCGCATGCAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTTTTGATATTGTTAAATTTCTCCTGATTTACCTCGCTACGCggtgggtg > 2:171806/1‑287 (MQ=255) ccTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTGTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTACACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGATCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTCTAGTTATGTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATCTCCCTCGCTAAGCGGtgcctg‑‑‑gcc > 2:137585/1‑285 (MQ=255) cTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGt > 1:949944/1‑245 (MQ=255) aTTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGACGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCg > 1:183792/1‑289 (MQ=255) gCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATTAACTCTTTCATGGTGCTATCATCCATCCATTTTTCAGTAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACTTGCATCTCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATa < 1:775138/289‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATaa < 1:888891/288‑1 (MQ=255) aaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcCTTAGTg < 1:1605770‑M1/7‑1 (MQ=255) tGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGc > 1:115197/1‑206 (MQ=255) tGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATAAACTCTCTTACCACGCCtt > 2:211450/1‑289 (MQ=255) tttGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATAAACTCTCTTACCACGCCTTg > 1:746582/1‑288 (MQ=255) tttGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATAAACTCTCTTACCACGCCTTGc > 2:1516670/1‑289 (MQ=255) tttatgaATTCTTTCAGAGTGCTGTTAACCAACCATGTTTTATGAGTAAACTGCGATTCGTTATCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTTAGAGTACATTGTAAACTGGAGGGCGTGGCTGTAACGTTCATCGATATCTCGCTCAACAAGGCGGCGGATAAATCCGCTGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATGTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATAAACTCTCTTACCACGCCTTGCa < 2:535741/286‑1 (MQ=255) tgatgaACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATAAACTCTCTTACCACGCCTTGCAt < 1:190999/289‑1 (MQ=255) gatgaACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGGTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTTATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGTTAAACTCTCTTACCACGACTTGcct > 2:1487844/1‑286 (MQ=255) ctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcccttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTATACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATAAACTCTCTTACCACGCCTTGCAt < 1:1427699‑M1/95‑1 (MQ=255) tgaACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTa < 2:1252766/215‑1 (MQ=255) tgaACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATa > 1:1167000/1‑263 (MQ=255) tgaACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCAATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATAACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTACATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCTGCGGAACAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GTTGCTGTCGATAAACTCTCTTACCACGCCTTGTAtcct > 2:400392/1‑287 (MQ=255) tGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATAAACTCTCTTACCACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCgg > 1:330395/1‑289 (MQ=255) 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tccatTTTTCATGAGTAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATAAACTCTCTTACCACGcc > 1:432061/1‑253 (MQ=255) tAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGa > 2:1126795/1‑165 (MQ=255) tAAACTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGa < 1:1126795/165‑1 (MQ=255) aaCTGCGACTCTTTTTCAAGGTAAAAACAGTAATCACATTTGAGATTACATTGAAAACTGGAGGGCTTGGCTGTAACGTGCATCGCTATCTCGCTCAATAAGGCGGCGGAAAAATCCGCCGCATGAAGGTTTAGTTATTTCGCTTCGCTTAGTGCTTTCTTGATATTGTTAAACTTCTCCTGATTTACCTCGCTAAGCGGTGGCTG‑‑‑GCTGCTGTCGATAAACTCTCTTACCACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCt > 2:381149/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |