| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3220396 | 188 (1.130) | coding (905/1380 nt) | patA | putrescine:2‑oxoglutaric acid aminotransferase, PLP‑dependent | |||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
AGCGCTGAAGCTGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTGAAGAGGTGTTTTCAGTTCTGTTCGACAACCCATTCCTGCATACCACCACCTTTGGCGGCAACCCGCTGGCCTGTGCGGCGGCGCTGGCGACCA > NC_000913/3219959‑3220530 | gtcgcTGAAGCTAGCGAAAGCGTCCCCGTGCCCGGCCGGCAAGGTTACTTTGTTGGCCACCAGGGGCGCGTTCCACAGTAAACCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAACCGACCTTCCGCTAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATCTCGGAGCCATGCGCACGGCTCTTGACGCGTGCAAAAAAACCGGTGATGCTGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGc < 2:1107928/287‑1 (MQ=255) 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tGGCGACAGCGTAACACTAACCGCGCGGCACGTTTACCTTTAGGACCACATCCGACGCATTCCACGGGAAATCCCTTGCCGGGCTGGCGGCCACGGCGAGATAGTCCGTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGGCATGTTCCGTTTGGCAATATCGAAGCTATGCGAACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGCTGATGTGACTGCGGTGTGCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 2:688546/289‑1 (MQ=255) tGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 2:849977/289‑1 (MQ=255) tGGCGAAAGCTTACCAGTCACCGCGCGGCAAGTTTACTTTTATGGCCACCAGCGGCGCGTTCCCCGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCGGTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCAccgc < 1:872857/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |