New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1387098 | 154 (0.890) | 4 (0.020) | 3/496 | NT | 2.6% | coding (379/1542 nt) | tyrR | aromatic amino acid biosynthesis and transport regulon transcriptional regulator, autorepressor, ATPase, phosphatase |
? | NC_000913 | = 1387248 | 154 (0.910) | coding (529/1542 nt) | tyrR | aromatic amino acid biosynthesis and transport regulon transcriptional regulator, autorepressor, ATPase, phosphatase |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
TTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCCTGACCGGTGCGGTGGT‑GATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGAAGCATGTTGTCGAACAGGCGCAGAAACTGGCGATGCTAAGCGCGCCGCTGCTGATTACGGGTGACACAGGTACAGGTAAAGATCTCTTTGCCTACGCCTGCCATCAGGCAAGCCCCAGAGCGGGCAAACCTTACCTGGCGCTGAACTGTGCGTCTATACCGGAAGATGCGGTC > NC_000913/1386963‑1387532 | ttGAGCGAGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACATGAGCTCTCTGTCGATATGAAAAGGAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGTGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAATGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTTGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCCTGACCGgtg > 2:1197204‑M2/1‑286 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |