| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 2077808 = | 169 (0.980) | 4 (0.020) | 4/484 | NT | 2.4% | coding (240/375 nt) | cbtA | CP4‑44 prophage, toxin of the YeeV‑YeeU toxin‑antitoxin system |
| ? | NC_000913 | 2077982 = | 158 (0.960) | pseudogene (43/168 nt) | yeeW | CP4‑44 prophage, uncharacterized protein,Phage or Prophage Related | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
GATGAACGTGTGATTGAGCAGCATATTGAGGCAGGCATTTCACTGTGTGATGCGGTGAACTTTCTCGTGGAAAAATACGCGCTGGTGCGTACCGACCAGCCGGGATTCAGCGCCTGTACCCGCTCTCAGTTAATAAACAGCATCGATATCCTCCGGGCTCGCAGGGCGACCGGCCTGATGACCCGCGACAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATAT‑GGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGATGTCCTTACCCTGCGCCATCTGCAGCTTCTGCACCAGAACCGGTGAA > NC_000913/2077701‑2078261 | aCGTGTGATTGAGCAGCATATTGAGGCAGGCATTTCACTGTGTGATGCGGTGAACTTTCTCGTGGAAAAATACGCGCTGGTGCGTACCGACCAGCCGGGATTCAGCGCCTGTACCCGCTCTCAGTTAATAAACAGCATCGATATCCTCCGGGCTCGCAGGGCGACCGGCCTGATGACCCGCGACAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATAT‑GGGGcaca < 1:1579591/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |