| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,320,743 | T→A | 2.6% | H290L (CAT→CTT) | yhbX ← | putative EptAB family phosphoethanolamine transferase, inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,320,743 | 0 | T | A | 2.6% | 567.9 / 3.1 | 154 | H290L (CAT→CTT) | yhbX | putative EptAB family phosphoethanolamine transferase, inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (62/87); new base A (2/2); total (64/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.02e-01 | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
TGCGGTTGAAACACGGCGCTGGATTGCGGATAGGCGCTACAAGCCGGTTCATGGCTTCCATTTAAATGAAGAACAATCAGTTTCTTTTGCTGCGTATTTTGCTGTAATGCTTGCGATAAATGCGGCAACAACAATTCATCAAATCCTCTGACATAAACTGTTTCCATGGCGCGCATGGCGATACTGGTAACTGCTGTACCATTCTGCCGAAAAGCGGATTGCGAGCTTAGCCAGAAAGTCTGAAATCCTGCTTGATTAGCCATATTAATAATGTTGTCGGGGTAATTATGAATGTCATGACTCAAAACAGAATCAGCAGTTAAAGAAAGGGGAACCGACAGCGCAGTGTAAGGTGCGCCGCTTATTGCTTGATTAAACAGTTTGATCTGTTTTCTTTGTGCTTCAACTTGCGGTGTCGTAGAGCGTGTATATCCATACAAAGACATATTGTCGACACGTACAGACTCCCCCACAATCAACACGTAGGTATCAATACCTGTATCCCTGACTGATAATTGAAAATACGGCACCGTGTTTGCAATTGAGAGTAATCTTTGATGCTCTTTCGCTG > NC_000913/3320455‑3321025 | aaaCACGGCGCTGGATTGCGGATAGGCGCTACAAGCCGGTTCATGGCTTCCATTTAAATGAAGAACAATCAGTTTCTTTTGCTGCGTATTTTGCTGTAATGCTTGCGATAAATGCGGCAACAACAATTCATCAAATCCTCTGACATAAACTGTTTCCATGGCGCGCATGGCGATACTGGTAACTGCTGTACCATTCTGCCGAAAAGCGGATTGCGAGCTTAGCCAGAAAGTCTGAAATCCTGCTTGATTAGCCATATTAATAATGTTGTCGGGGTAATTATGAATGTCa < 2:543284/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |