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ccaccatatccattagcggaatggcgattatccacaaagcggtaaccgggctgatgggatgggttttgccctgggtcgtttcgagcaggatccagataacggtaaaaccaatcagcgtactgcccgcatcacccataaagactttgtagcggcgacccaggataccaaggttaagcatgatgtatggcaggatggcggcgatcatcgcaaagcaccagattgcgaggctggtttgcccgtcgaaccacaaaatcataccgattgctgcaaacg > 1:589087‑M1/1‑3 (MQ=255) caccatatccattagcggaatggcgattatccacaaagcggtaaccgggctgatgggatgggttttgccctgggtcgtttcgagcaggatccagataacggtaaaaccaatcagcgtactgcccgcatcacccataaagactttgtagcggcgacccaggataccaaggttaagcatgatgtatggcaggatggcggcgatcatcgcaaagcaccagagtgcgaggctggtttgcccgtcgaaccacaaaatcataccgattgctgcaaacgagacgcaggacaacccg < 2:799136‑M1/289‑288 (MQ=255) | 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |