| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3498079 | 114 (0.780) | 5 (0.040) | 5/502 | NT | 4.3% | coding (254/1374 nt) | cysG | fused siroheme synthase 1,3‑dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase |
| ? | NC_000913 | = 3498084 | 113 (0.800) | coding (259/1374 nt) | cysG | fused siroheme synthase 1,3‑dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CTGCCGGTTAATTACTAAGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATGCGCCGAAAGCCGCCAGCTTTATTATGCCGTCGATTATTGACCGCTCACCGCTCATGGTAGCGGTCTCCTCTGGCGGCACCTCTCCGGTTCTGGCACGCCTGTTGCGCGAAAAACTTGAATCACTGCTGCCGTTACATCTGGGCCAGGTAGCGAAATACGCCGGGCAATTACGCGGGCGAGTGAAACAACAGTTCGCCACGATGGGTGAGCGTCGCCGTTTCTGGGAGAAATTGT > NC_000913/3497797‑3498372 | cTGCCGGTTAATTACTAAGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGCCGGATGATGACGCGCTTAACCa < 1:1268298‑M2/289‑2 (MQ=255) tGCCGGTTAATTACTAAGGGTTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGCTGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCag > 2:651416‑M2/1‑287 (MQ=255) gCCGGTTAATTACTAAGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGAGGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACCCCTGCTGGCTGCCGATTGGCGCGACGGATGACGACGCGCTTAAcccc > 2:957170/1‑286 (MQ=255) cGGTTAATTCCTAGGGGGTTTTTACGTGGTTCATTGGCCTATAAGTGGCCAATTACGCGAGGTGGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGGGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTGGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCagcg > 2:871291‑M2/1‑284 (MQ=255) aTTACTAAGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGGTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCGCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCagcgcgtcatc > 1:616360‑M2/1‑278 (MQ=255) tACTAAGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGa < 2:579598/289‑1 (MQ=255) aGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGcc > 1:864453/1‑288 (MQ=255) aGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCg < 1:1170951/289‑1 (MQ=255) tttttACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGGCGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGGTGATGACGCTGTTAACCagcgggtcaccatacttcgctg < 1:1101445‑M2/288‑23 (MQ=255) tttttACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGAGGATGAAGCGCTTACCCAGCGCGtacacatccgtggatgc > 1:736125/1‑273 (MQ=255) tttttACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCCGATTGTCGCCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACCCGCTTAAACATCGCGTCAGCGAAGCCGCTGaa > 2:342573/1‑289 (MQ=255) tttgtcggggATCATTGGCCTATGTTTGTCAAATTGCGCGATCGCTACTGACTAATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAg < 2:920288/281‑1 (MQ=255) tttACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAg > 1:892743/1‑288 (MQ=255) 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CTGCCGGTTAATTACTAAGGGGTTTTTACGTGGATCATTTGCCTATATTTTGCCAATTACGCGATCGCGACTGTCTGATTGTCGGCGGTGGTGATGTCGCGGAACGCAAAGCAAGGTTGCTGTTAGACGCAGGCGCTCGCTTAACGGTGAATGCATTAGCGTTTATTCCACAGTTCACCGCATGGGCAGATGCAGGCATGTTAACCCTCGTCGAAGGGCCATTTGATGAAAGCCTTCTCGACACCTGCTGGCTGGCGATTGCAGCGACGGATGATGACGCGCTTAACCAGCGCGTCAGCGAAGCCGCTGAAGCTCGTCGCATCTTCTGTAACGTGGTCGATGCGCCGAAAGCCGCCAGCTTTATTATGCCGTCGATTATTGACCGCTCACCGCTCATGGTAGCGGTCTCCTCTGGCGGCACCTCTCCGGTTCTGGCACGCCTGTTGCGCGAAAAACTTGAATCACTGCTGCCGTTACATCTGGGCCAGGTAGCGAAATACGCCGGGCAATTACGCGGGCGAGTGAAACAACAGTTCGCCACGATGGGTGAGCGTCGCCGTTTCTGGGAGAAATTGT > NC_000913/3497797‑3498372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |