| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,579,809 | A→T | 2.8% | C328S (TGT→AGT) | ydeM ← | putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,579,809 | 0 | A | T | 2.8% | 548.7 / 2.9 | 143 | C328S (TGT→AGT) | ydeM | putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (76/63); new base T (2/2); total (78/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
TTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTACCATGGCGTTCATATAAGGTACCATGGTTGAAAAAAGGATTTTATAACCTTCGCAAAAATAAGAAACAGTCTCATTGTTTACTTTAGTAATACGATGCTTAGGACAACCGCCATTGCAGATAGGTTTATATGCACATTGCTGACATTTCGCTGGAATCCGTTTTTTTTGCGCTGTCAGTTGTACACTGTTCATCGTTTTGAGTTCAGATTTATTAATGTTTCCAATTTTGTACTGTGGATAGACAAAATGGTCGCATTCGTAAATGTCTCCATTACTTTCAACAACCAGATTATCCTTGCAGGACTCCTGGAAAATACAACTGGTATGCCCATTCCCCAAAAAACGGCTGACAAAGCTTTCAAACTGACGGATGAAAATTTCACCCACATC > NC_000913/1579524‑1580094 | ttttCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTACCATGGCGTTCATATAAGGTACCATGGTTGAAAAAAGGATTTTATAACCTTCGCAAAAATAAGAAACAGTCTCATTGTTTACTTTAGTAATACGATGCTTAGGACAAc < 2:195956/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |