Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,508,892 | G→A | 6.3% | A307V (GCA→GTA) | yhfW ← | phosphopentomutase‑related metalloenzyme superfamily protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,508,892 | 0 | G | A | 6.3% | 567.8 / 9.8 | 191 | A307V (GCA→GTA) | yhfW | phosphopentomutase‑related metalloenzyme superfamily protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (86/90); new base A (11/2); total (98/93) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.87e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
ACCGGAGGGAGGAAAGAAAAGAGCGACCATTTTGTGGCGGTGGCGCGCGGAAAAATTCACACACGGTAGCCCCCACATCAGAAAGCGTGGTGCGCACACCGAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGATTGTTGACGATATCTGCCACCTTACCCACCAGCACGGTTGGCACGCCTGCTTCATACAGTTTTTGTGGCACCTGCACTTTTTCATCGACGCCATAGCCCATATGCACGACCTGGAAACCGTTGTCATAAGCGCCAGAACGCGG > NC_000913/3508605‑3509178 | aCCGGAGGGAGGAAAGAAAAGAGCGACCATTTTGTGGCGGTGGCGCGCGGAAAAATTCACACACGGTAGCCCCCACATCAGAAAGCGTGGTGCGCACACCGAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGc > 1:738312/1‑289 (MQ=255) aaagaaaagaGCGACCATTTTGTGGCGGTGGCGCGCGGAAAAATTCACACACGGTAGCCCCCACATCAGAAAGCGTGGTGCGCACACCGAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGAACAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACATGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGc > 1:762731/1‑289 (MQ=255) agagCGACCATTTTGTGGCGGTGGCGCGCGGAAAAATTCACACACGGTAGCCCCCACATCAGAAAGCGTGGTGCGCACACCGAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTACGACGTCTTCTGCATGACCa > 1:601808/1‑289 (MQ=255) agCGACCATTTTGTGGCGGTGGCGCGCGGAAAAATTCACACACGGTAGCCCCCACATCAGAAAGCGTGGTGCGCACACCGAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGGCAACGACCTGCAAACGTTAGGCATCACGTCCGACGTCTTCTGCATGACCAGc > 1:664435/1‑289 (MQ=255) 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ttttTGGCGGTGGCGCGCAGAAAAATTCACACACGGTAGCCCCCACATCAGAAAGCGTGGTGCGCACACCGAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGt < 1:72017/289‑1 (MQ=255) tttGTGGCGGTGGCGCGCGGAAAAATTCACACACGGTAGCCCCCACATCAGAAAGCGTGGTGCGCACACCGAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGt < 1:1207928/289‑1 (MQ=255) ggcggtggcgCGCGGAAAAATTCACACACGGTAGCCCCCACATCAGAAAGCGTGGTGCGCACACCGAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCt < 1:1064946/289‑1 (MQ=255) 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ACCGGAGGGAGGAAAGAAAAGAGCGACCATTTTGTGGCGGTGGCGCGCGGAAAAATTCACACACGGTAGCCCCCACATCAGAAAGCGTGGTGCGCACACCGAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGATTGTTGACGATATCTGCCACCTTACCCACCAGCACGGTTGGCACGCCTGCTTCATACAGTTTTTGTGGCACCTGCACTTTTTCATCGACGCCATAGCCCATATGCACGACCTGGAAACCGTTGTCATAAGCGCCAGAACGCGG > NC_000913/3508605‑3509178 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |