| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 550165 | 116 (0.960) | 3 (0.030) | 3/512 | NT | 2.2% | coding (539/816 nt) | ylbF | putative anaerobic allantoin catabolic oxamate carbamoyltransferase, DUF2877 family protein |
| ? | NC_000913 | = 551959 | 150 (1.260) | coding (636/1068 nt) | purK | N5‑carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
TTTGTCGTACCAGTGCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCT‑TCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAACACTCTGCCGGTAACTGTTCGGTTTCATTTGCGCGTAAACGCCATTGACCGCGACCGTCATAACCACCAGTGCGACGCTTAACAATCG > NC_000913/551674‑552245 | gTACCAGTGCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACT‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGc < 2:874065/289‑1 (MQ=255) tGCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGATCGCTGTTATGCCCACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGCCCTTGCGGGGTGACAACACACTCCATCTCCATTCCGCCCACATACCCCAGCTCCTGCATAAACGCCGATACCATctct > 2:379846/1‑288 (MQ=255) aTGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGTCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCCCGCCCCAATAGCCCAGCCCCTGCCTAACCGCCGACACCAACTCT‑TCGGCt > 1:343930/1‑289 (MQ=255) ccAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCCCCTGCATAATCCACGACAGCATCCCT‑TCGGCTTgcg > 1:824096/1‑288 (MQ=255) gCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCT‑TCGGCTTGCGCct > 1:978248/1‑288 (MQ=255) aGTTTCGGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATGGATCATCACCGACGTATTATTCACCACTGGGTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCGAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGTGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCT‑TCGGCTTGCGCctgctgct < 1:556783/289‑1 (MQ=255) taagtgccatgTCATAATTCCCATCGCTACCAATCAGCTTGTTCATCACCGACTGATGATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTCATGTCCCGCGGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GGTTTGGGCCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAGACACTCCATCGCCATCCCGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCG‑TCGGCTTGCGCctgctgct < 1:721031/278‑1 (MQ=255) gTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCT‑TCGGCTTGCGCctgct > 2:608640/1‑285 (MQ=255) gTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGCTCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCT‑TCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGc < 2:215898/288‑1 (MQ=255) cacaTCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACCCTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCCCCGACAGCCTCCCT‑TCGGCTTTCGCCTGCTGGTTTGCGTTGGCCTGCGGaaaa > 1:406357/1‑289 (MQ=255) 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cTCCGGCATAACGGCCGACAG‑AACTCTGTCGGCGTGCGCCTGCGGCTGTGCGTTGGCCGGCTGAAAAGCGACGCTGGGGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGGGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAACACTCTGCCGGTAACTGTTCGGTTTCATTTGCGCGTAAACGCCATTGACCGCGACCGTCATAACCACCAGTGCGACg < 1:980959/288‑1 (MQ=255) gCATAATCGCCGACAGCATCTCT‑TCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAaca < 2:641933/208‑1 (MQ=255) gCATAATCGCCGACAGCATCTCT‑TCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAaca > 1:641933/1‑208 (MQ=255) gCATAATCGCCGACAGCATCTCT‑TCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAACACTCTGCCGGTAACTGTTCGGTTTCATTTGCGCGTAAACGCCATTGACCGCGACCGTCATAACCACCAGTGCGACGCTTAAc > 1:648702/1‑289 (MQ=255) aTAATCGCCGACTGCATCTCT‑TCGGCTTGCGCGTGCTGCGGTGCGGTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGGGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAACACTCTGCCGGTAACTGTTCGGTTTCATTTGCGCGTAAACGCCATTGACCGCGACCGTCATAACCACCAGTGCGACGCTTAACa < 2:541626/288‑1 (MQ=255) tCGCCGACAGCATCTCT‑TCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAACACTCTGCCGGTAACTGTTCGGTTTCATTTGCGCGTAAACGCCATTTACCGCCACCGTCATAACCACCCGTACGACGCTTAACAATCg > 1:599329/1‑288 (MQ=255) | TTTGTCGTACCAGTGCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCT‑TCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAACACTCTGCCGGTAACTGTTCGGTTTCATTTGCGCGTAAACGCCATTGACCGCGACCGTCATAACCACCAGTGCGACGCTTAACAATCG > NC_000913/551674‑552245 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |