| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 852936 = | 140 (1.160) | 4 (0.030) | 3/504 | NT | 2.8% | coding (62/129 nt) | mntS | Mn(2)‑response protein, MntR‑repressed |
| ? | NC_000913 | 854010 = | 139 (1.180) | coding (364/1119 nt) | ybiR | putative transporter | |||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
AGCTTTTTCGTGCCCTTTGCACCGAAATCCTGGCCTGCTGCTATCGACTGGCACACCATCATCACCTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGGCAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGATGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTGGGGCTGTATATCGTCTTTCTGAC > NC_000913/853722‑854290 | aGCTTTTTCGTGCCCTTTGCACCGAAATCCTGGCCTGCTGCTATCGACTGGCACACCATCATCACCTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCCCGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATc > 2:1032571/1‑289 (MQ=255) tGCACCGAAATCCTGGCCTGCTGCTATCGACTGGCACACCATCATCACCTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACAGGATGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAg > 2:383634/1‑289 (MQ=255) tGCACCGAAATCCTGGCCTGCTGCTATCGACTGGCACACCATCATCACCTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGATTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGCCTGTGTGAAATCCCGGTTACTCGGCTGATTATTTTTGAg > 1:286315/1‑289 (MQ=255) gCCTGCTGCTATCGACTGGCACACCATCATCACCTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTg < 2:859604/272‑1 (MQ=255) cagctATCGACTGGCACACCATCATCACCTTAAGCGGCCTGATGATGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGTTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTGCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGTTTAGTGTTGTTCCGCTGACTCTCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATGGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGGCAGTCAAAGCTgg > 2:446119/3‑289 (MQ=255) cGACGGGCACACCATCATCACCTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGGTGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAGCGATGTCGC‑GCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGGCAGTCAACGCTGGTTCGCTa < 2:96185/289‑1 (MQ=255) atggtgacgcatacatagcgttctcatttcgtgcgcacattgtaaaccagagttgcgaaggtacaaaaaattaacgttttagcaatagctatataatatagcctgtgctatatctgtatgtaatgcaatcatccctcaaggatcgacgggattagcaagtcaggaggtcttatgaatgagttcaagaggtgtatgcgcgtgtttagtcattctccctttaaagtacggttaatCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGGCAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAAt > 2:464894‑M2/234‑289 (MQ=255) atggtgacgcatacatagcgttctcatttcgtgcgcacattgtaaaccagagttgcgaaggtacaaaaaattaacgttttagcaatagctatataatatagcctgtgctatatctgtatgtaatgcaatcatccctcaaggatcgacgggattagcaagtcaggaggtcttatgaatgagttcaagaggtgtatgcgcgtgtttagtcattctccctttaaagtacggttaatCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGGCAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAAt > 2:893862‑M2/234‑289 (MQ=255) ccTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGGTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATACCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGATGCGTTGGCAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCCATTggtcacc > 2:305745/1‑283 (MQ=255) cTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGGCAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCg < 1:979488/289‑1 (MQ=255) 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aaGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGGCAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCaa > 1:374031/1‑289 (MQ=255) aaGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGGCAGTCAACGCCGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCaa > 2:541559/1‑289 (MQ=255) aagtgtctgtggcggctgACCAAAGGTGTGGAGTTAAGAGGTTGTTTTGGTGTGGTGGTGCGCAACATTGGGCGCCTCTTTGCTACGGAGCTTCGCCTGGCTATGTTTATGGTGCTGTCCGCTGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCGTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGTTTATTGTTGTTCTGCTGACTGTCGCGCTAACAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGTGCCCCTGGCAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGAGGCCAATTTTCAACCCGCaaa < 1:608524/275‑1 (MQ=255) aGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGGCAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCaaa < 2:970001/289‑1 (MQ=255) cTGATTCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTACGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGGTTAGGGTGATGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGGCGC‑GCTGTGTATGGTTGTTCCGCAAACTATCACGCTAAAACGCCTTTGTGAGATCCGGGTTACTCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGGCAGTCAAGACTGGTTCCCTTCGGACGCAACTTTGCAACCCGCAAAatatcg > 1:931087/1‑287 (MQ=255) cTGATGCTGCTGCCCAAAGGTGTGGATTTAAGCGGTTATTTTAATGTGCTGGGGCGCAAAATGGGGCGCCGCTTTGCTACGGGGCGTCGGCGAGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGC‑‑‑GCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGC‑GCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGGCAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTc < 2:295985/289‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
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| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |