Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 199,346 | 0 | A | G | 3.2% | 494.6 / 2.6 | 140 | V473V (GTA→GTG) | bamA | BamABCDE complex OM biogenesis outer membrane pore‑forming assembly factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (67/68); new base G (2/3); total (69/71) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.11e-01 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GGAGCGATCTGGTCGATCAGGGTAAGGAGCGTCTGAATCGTCTGGGCTTCTTTGAAACTGTCGATACCGATACCCAACGTGTTCCGGGTAGCCCGGACCAGGTTGATGTCGTCTACAAGGTAAAAGAGCGCAACACCGGTAGCTTCAACTTTGGTATTGGTTACGGTACTGAAAGTGGCGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGACCTGTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAGACGTGACGTTGGGCTTCCCGATTAACGAATATAACTCGCTGCGTGCAGGTCTGGGTTATGTACATAACTCCCTGTCCAACATGCAGCCTCAGGTTGCGATGTGGCGTTATCTGTACTCTATGGGTGAACATCCGAGCACCTCTGATCAGGATAACAGCTTCAAAACGGACG > NC_000913/199060‑199632 | ggAGCGATCTGGTCGATCAGGGGAGGGAGCGTCTGATTCGTCTGGGCTTCTTTGTAACTGTCGATACCGATACCCAACGTGTTCCGGGTAGCCCGGACCAGGTTGATGACGTCTACAAGGTAAAAGAGCGCAACACCGGTAGCTTCAACTTTGGTATTGGTTACGGTACTGAAAGTGGCGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGGCGGTaa < 2:609468/288‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |