New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 3727434 | 116 (1.280) | coding (314/342 nt) | yiaB | YiaAB family inner membrane protein |
AACAAAATCAGGAAATAATAAATTAAATCGTTGCTGCATTGCCAATGGTTGTTGCCTTATATAGGGTAACAACGTTGAAAAACCACATGTGATGATATTGTGATAGTTAGCGATGCCGGGTTTGTATCGTGCCTTTTCATTTATTTCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAG > NC_000913/2996077‑2996627 | aacaaAATCAGGAAATAATAAATTAAATCGTTGCTGCATTGCCAATGGTTGTTGCCTTATATAGGGTAACAACGTTGAAAAACCACATGTGATGATATTGTGATAGTTAGCGATGCCGGGTTTGTATCGTGCCTTTTCATTTATTTCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGAttt > 2:338906/1‑289 (MQ=255) ataaATTAAATCGTTGCTGCATTGCCAATGGTTGTTGCCTTATATAGGGTAACAACGTTGAAAAACCACATGTGATGATATTGTGATAGTTAGCGATGCCGGGTTTGTATCGTGCCTTTTCATTTATTTCCAGCGGTATAGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTAT‑AAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAc < 2:130135/289‑1 (MQ=255) aatCGTTGCTGCATTGCCAATGGCTGTTGCCTTATATAGGGTAACAACGTTGAAAAACCACATGTGATGATATTGTGCTAGTTAGCGATGCCGGGATTGTATCGTGCGTCTACATTTATTTCCAGCGGTATAGTTGATATATCATCCCTTAGTACATCAGTCACCTTATCAAAAAACCCGCGTTTTACAAACCTTTCTCGATAAAAGTTCCAACCAATACGTAAAAAGTTCAATGGCAGTAAATTCAAATTGTTTACTgg > 1:130016/1‑260 (MQ=255) gctgcATTGCCAATGGTTGTTGCCTTATATAGGGTAACAACGTTGAAAAACCACATGTGATGATATTGTGATAGTTAGCGATGCCGGGTTTGTATCGTGCCTTTTCATTTATTTCCAGCGGTATAGCTTATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCAGCGTTCTGCAACCCTCTCCCGATAAAAGTTACAACCACTGATTAAACAGATCAATGGAAGTCAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCACTATATTTTCATACATCTGTTATccatt > 1:698111/1‑285 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |