New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 3832393 = | 98 (1.120) | coding (2144/2319 nt) | yicI | putative alpha‑glucosidase |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TGAATGCTGGCATCGTTTCCAGCGGTGAAGTTACATCGACGGAGCCGGTGCGGTAAACATCAATCTCGCCGGGTACGACTCAGACGTACCCGGCATTCCATCAATAGATTACAACGTAATTGTCAGCGCATTCCCTTGAGGCTTCACCACCAGCCCCTGCTCACTTTCAGCCTGCGAACCGTCTTGCAGACCATTTACTTTCACAACATTGCGC‑AGGCACAGTGTCCAGTTCTTCGCCTCGCCCGCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGTGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGTTCATCGTTGTGCCACAGGTGTGTCCAGCGACCTTCCGGCAGGTAGAACTGCACATCGCCCGCTTCAGT > NC_000913/3832110‑3832676 | cttgctgctttgcggcgttcacggcatgcaattgcccgctaaccgtaggtttcaacgggacattggcctgaatatcgccactggcggtaagctgaatattgccgtcgccagtcaacggtaattcaggccatccccactgttgcaaaatattcaccggcacaccgcgtccatacaggctgatacgtgtctgacgttgtggcgtttgtgaaacactgtcgggggcttccagaatgcctttttcagtaaatgcactaagttcgctgatattcaccgctctgctttcggcgg > 1:111696‑M2/281‑282 (MQ=255) 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ctgctTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGTGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGTTCATCGTTGTGCCACAGGTGTGTCCAGCGACCTTCCGGCAGGTAGAACTGCACATCGCCCGCTTCAGt > 1:389817‑M2/6‑289 (MQ=255) | TGAATGCTGGCATCGTTTCCAGCGGTGAAGTTACATCGACGGAGCCGGTGCGGTAAACATCAATCTCGCCGGGTACGACTCAGACGTACCCGGCATTCCATCAATAGATTACAACGTAATTGTCAGCGCATTCCCTTGAGGCTTCACCACCAGCCCCTGCTCACTTTCAGCCTGCGAACCGTCTTGCAGACCATTTACTTTCACAACATTGCGC‑AGGCACAGTGTCCAGTTCTTCGCCTCGCCCGCACCAGTCACAGTAATCGTGTTGCCAGTACGTGCTGCTTTTAAAGTAAAGATCACCGATCCGTCAGCAGCGGGCACTTCACAGACGGCTTCATGCCCGTCTTGCAGATTGAAGAGGTGGAATGCCGTGCCTTCGTGCCACACGTAATCGGGACGTTGATCGTTGTTGCCCAGCGCCAGTAGAGTGTTATCACGCACATAAACGGGCAGACTCAGGAAGCCGTGCTGCTGTTTATGCCAGCGACTACCGTCGAGTTCATCGTTGTGCCACAGGTGTGTCCAGCGACCTTCCGGCAGGTAGAACTGCACATCGCCCGCTTCAGT > NC_000913/3832110‑3832676 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |