Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,148,282 | 0 | T | A | 4.5% | 311.9 / 2.2 | 89 | L221* (TTA→TAA) | plsX | putative phosphate acyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/42); new base A (2/2); total (44/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.16e-01 |
AGCGTCCGGCGCTGGTGACGGTATTACCACATCAGCAAAAGGGCAAAACGGTGGTCCTTGACTTAGGGGCCAACGTCGATTGTGACAGCACAATGCTGGTGCAATTTGCCATTATGGGCTCAGTTCTGGCTGAAGAGGTGGTGGAAATTCCCAATCCTCGCGTGGCGTTGCTCAATATTGGTGAAGAAGAAGTAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATCGGCTATCTTGAAGCCAATGAGTTGTTAACTGGCAAGACAGATGTGCTGGTTTGTGACGGCTTTACAGGAAATGTCACATTAAAGACGATGGAAGGTGTTGTCAGGATGTTCCTTTCTCTGCTGAAATCTCAGGGTGAAGGGAAAAAACGGTCGTGGTGGCTACTGTTATTAAAGCGTTGGCTACAAAAGAGCCTGACGAGGCGATTCAGTCACCTCAACCCCGACCAGTATAACGGCGCCTGTCTGTTAGGATTGCGCGGCACGGTGATAAAAAGTCATGGTGCAGCCAATCAGCGAGCTTTT > NC_000913/1147997‑1148559 | aGCGTCCGGCGCTGGTGACGGTATTACCACATCAGCAAAAGGGCAAAACGGTGGTCCTTGACTTAGGGGCCAACGTCGATTGTGACAGCACAATGCTGGTGCAATTTGCCATTATGGGCTCAGTTCTGGCTGAAGAGGTGGTGGAAATTCCCAATCCTCGCGTGGCGTTGCTCAATATTGGTGAAGAAGAAGTAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATCGGCTATCTTGAAGCCAATGAGTTGTTa > 2:747053/1‑287 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |