| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,763,484 | 0 | A | G | 3.3% | 425.9 / 2.5 | 122 | S19P (TCG→CCG) | yfjK | radiation resistance protein, DEAD/H helicase‑like protein, CP4‑57 putative defective prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (62/56); new base G (2/2); total (64/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.18e-01 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
TTGAGCAGATCGAATATGTGGAACTGCATTGAGTGGAAAACATAACCATCCGAGAATGGCGTCCGGTATAGCTCAAGCACCCTCAGGTCATCCGGTGTCAGGCTGGTGAACTCCTTTTTGAGATACGGGAACAAACCTGATTTTCTCACCATATTTTTCAAAATTGTGGTGTGCTCGGAAAACCGCTCGCGCGAATCGAGAGCTCGCACGATCAAGTCCCGTCCCAAGTCATACGAAACAGGGTTAGACAACAGCTTGTTAACCGCAAACAGATAATTGAACGATGAGAAGTCCTCACCCTGCAGGCTATGTTTCGCCTGTTCATAGATCTCTGTCATACGACCTCTCTCACCTTCTCATCAACTAATTGGGTTAACCGCTCAAGACTCGGGGCTGGATAAATGAATACGTGGATGCAAAGATTCGCAAACGGCGAATCCTCGATGAGGTCAGCCGCGAATTTTTCGAACAGCACCGCTGTTTCTTTCTCCAGGTCATCCTCGAACCCCGGCGTTTCAGGCTCGGTTAGTAGATTAGAGTCGTAGCCCACGAACAGAAC > NC_000913/2763201‑2763759 | ttGAGCAGATCGAATATGTGTAACTGCATTGAGTGGAAAACATAACCATCCGAGAATGGCGTCCGTTATAGCTCAAGCACCCTCAGGTCATCCGGTGTCAGGCTGGTGAACTCCTTTTTGAGATACGGGAACAAACCTGATTTTCTCACCATATTTTTCAAAATTGTGGTGTGCTCGGAAAACCGCTCGCGCGAATCGAGAGCTCGCACGATCAAGTCCCGTCCCAAGTCATACGAAACAGTGTTAGACAACAGCTTGTTAACCGCAAACAGATAATTGAACGATgaga < 2:398628/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |