Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 51,782 | 0 | C | . | 3.2% | 446.5 / 5.8 | 126 | coding (649/822 nt) | rsmA | 16S rRNA m(6)A1518, m(6)A1519 dimethyltransferase, SAM‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (59/63); new base . (2/2); total (61/65) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
ATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAGGTGAAGATTGAGCCTCAATGTAGACGCTTTGAACCTGAATACACACTCGGGGCGAATTGATCATCGTTAACTCTCCTGCAAAGGCGCGTTCTCCGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATA‑TTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACATCTTTAACCGGGTGAGGCATCGTTGCATGAGGAACCAGGCGCACGACGGCGGAATCCACTTTGGGTGGTGGTGTAAAGGCTGACGGCGGTACTTCCAGTACCGGGATCACATTGCAATAGTATTGCGCCATGACGCTTAATCGACCATACGCTTTGCTGTTCGGTCCTGCAACCAGACGATTCACCACCTCTTTTTGCAACATAAAGTGCATGTCGGCAATGGCATCAGTATAGCTAAACAGATGGAACATCAA > NC_000913/51496‑52067 | aTTGCATAGGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTAGCAGGTGAATATTGAGCCTCAATGTCGACGCTTTGAACCTGAATACACACTCGGGGCGAATTGATCATCTTTAACTCTCCTGCAAAGGCGCGTTCTCCGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATA‑TTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCtt < 1:741562/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |